More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1430 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  48.1 
 
 		 765 aa  703    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  49.32 
 
 		 703 aa  667    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  52.03 
 
 		 757 aa  743    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  50.27 
 
 		 751 aa  688    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  45.17 
 
 		 689 aa  638    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  51.28 
 
 		 768 aa  720    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  47.21 
 
 		 691 aa  652    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  46.74 
 
 		 692 aa  636    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  46.74 
 
 		 692 aa  637    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  48.1 
 
 		 696 aa  658    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  47.01 
 
 		 692 aa  642    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  47.15 
 
 		 692 aa  642    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  47.01 
 
 		 692 aa  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  49.53 
 
 		 759 aa  684    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  49.4 
 
 		 759 aa  682    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  48.66 
 
 		 711 aa  640    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  49.32 
 
 		 746 aa  674    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  49.52 
 
 		 693 aa  665    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  51.24 
 
 		 710 aa  674    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  51.34 
 
 		 894 aa  694    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  48.11 
 
 		 706 aa  667    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  50.53 
 
 		 841 aa  719    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  46.07 
 
 		 802 aa  637    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  48.67 
 
 		 760 aa  675    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  51.49 
 
 		 758 aa  747    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  49.32 
 
 		 747 aa  679    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  47.01 
 
 		 692 aa  642    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0158  DNA topoisomerase I  46.1 
 
 		 765 aa  647    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  50.99 
 
 		 697 aa  664    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  52.79 
 
 		 831 aa  761    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  44.61 
 
 		 691 aa  638    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  51.08 
 
 		 758 aa  739    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  47.97 
 
 		 765 aa  700    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  49.45 
 
 		 691 aa  663    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  50.27 
 
 		 756 aa  737    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  46.74 
 
 		 692 aa  646    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  46.74 
 
 		 692 aa  636    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  55.02 
 
 		 711 aa  778    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  44.61 
 
 		 691 aa  638    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  47.82 
 
 		 758 aa  644    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  51.65 
 
 		 853 aa  746    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  71.52 
 
 		 780 aa  1100    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  50.94 
 
 		 851 aa  704    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  48.76 
 
 		 779 aa  711    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  48.98 
 
 		 693 aa  657    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  50 
 
 		 703 aa  664    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  46.94 
 
 		 700 aa  635    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  49.32 
 
 		 703 aa  669    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  89.09 
 
 		 836 aa  1412    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  48.99 
 
 		 758 aa  693    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  53.24 
 
 		 813 aa  762    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  49.01 
 
 		 694 aa  644    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  48.63 
 
 		 779 aa  709    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  48.11 
 
 		 695 aa  659    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  49.73 
 
 		 748 aa  668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  52.98 
 
 		 831 aa  764    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  50.94 
 
 		 851 aa  704    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  52.72 
 
 		 831 aa  761    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 789 aa  1607    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  51.89 
 
 		 767 aa  727    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  49.4 
 
 		 783 aa  680    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  65.64 
 
 		 793 aa  954    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  47.01 
 
 		 692 aa  642    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  50.53 
 
 		 776 aa  738    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  50.07 
 
 		 697 aa  656    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  48.85 
 
 		 702 aa  665    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  48.51 
 
 		 836 aa  640    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  45.21 
 
 		 865 aa  633  1e-180  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  46.74 
 
 		 692 aa  633  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  49.19 
 
 		 859 aa  634  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  46.67 
 
 		 700 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  46.2 
 
 		 692 aa  634  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  49.37 
 
 		 686 aa  627  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  45.35 
 
 		 798 aa  625  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  46.81 
 
 		 696 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  45.23 
 
 		 693 aa  624  1e-177  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  47.47 
 
 		 804 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  44.7 
 
 		 743 aa  621  1e-176  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  49.28 
 
 		 845 aa  617  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  46.06 
 
 		 798 aa  610  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  45.33 
 
 		 696 aa  609  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  51.67 
 
 		 834 aa  606  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  47.63 
 
 		 904 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1387  DNA topoisomerase I  47.32 
 
 		 884 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903307  normal  0.17492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1295  DNA topoisomerase I  46.89 
 
 		 884 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722616  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  47.62 
 
 		 914 aa  605  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  45.5 
 
 		 798 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  45.08 
 
 		 715 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  48.59 
 
 		 797 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  46.88 
 
 		 691 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  44.74 
 
 		 799 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  51.03 
 
 		 783 aa  598  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  44.57 
 
 		 690 aa  600  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  45.3 
 
 		 706 aa  598  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  44.67 
 
 		 706 aa  598  1e-169  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  47.26 
 
 		 798 aa  598  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  47.61 
 
 		 894 aa  595  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1354  DNA topoisomerase I  47.63 
 
 		 849 aa  592  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.75959  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  48.76 
 
 		 824 aa  594  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1869  DNA topoisomerase I  51.18 
 
 		 815 aa  590  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>