170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0274 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 96 aa  190  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  81.25 
 
 		 96 aa  161  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  60 
 
 		 98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1766  DNA polymerase beta domain protein region  67.78 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.669718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3146  DNA polymerase beta domain protein region  55.67 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.94354 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 96 aa  99.4  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3140  DNA polymerase beta domain protein region  50.52 
 
 		 97 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.440273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2969  DNA polymerase beta domain protein region  50.52 
 
 		 97 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  52.58 
 
 		 97 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4907  DNA polymerase beta domain protein region  46.08 
 
 		 97 aa  96.3  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  57.14 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  49.46 
 
 		 97 aa  94.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5548  DNA polymerase beta subunit  47.78 
 
 		 93 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0258  DNA polymerase beta domain protein region  45.36 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1790  DNA polymerase beta domain protein region  47.25 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1203  DNA polymerase beta domain protein region  47.92 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2705  DNA polymerase, beta-like region  37.89 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1298  hypothetical protein  51.04 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5352  DNA polymerase, beta-like region  41.3 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50230  DNA polymerase, beta-like region-containing protein  42.22 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  45.26 
 
 		 97 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1812  DNA polymerase beta subunit  43.68 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.337517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3557  DNA polymerase beta subunit  44.83 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2288  DNA polymerase, beta-like region  41.11 
 
 		 96 aa  67  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  44.05 
 
 		 100 aa  67  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  33.68 
 
 		 97 aa  67  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  43.68 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1104  DNA polymerase beta domain protein region  40.7 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0953254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  40.21 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2452  DNA polymerase, beta-like region  37.5 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219498  normal  0.98292 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2148  DNA polymerase beta domain protein region  40.91 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1408  DNA polymerase beta subunit  40.91 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  44.79 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1295  DNA polymerase beta domain protein region  40.24 
 
 		 99 aa  63.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.599396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10090  predicted nucleotidyltransferase  43.75 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  36.71 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  36.47 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  38.96 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  40.91 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  38.16 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  39.47 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  41.05 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1203  DNA polymerase, beta-like region  36.56 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229672  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3948  DNA polymerase beta subunit  40.21 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  41.56 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2672  DNA polymerase, beta-like region  37.63 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.836328  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1221  nucleotidyltransferase domain-containing protein  52.46 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.795397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  35.48 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1527  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  36.67 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3147  DNA polymerase beta domain protein region  40 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.949814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  35.11 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  41.56 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  36.05 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  37.33 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  35.05 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4395  hypothetical protein  44.23 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0622266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  41.98 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  41.89 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  34.88 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0686  DNA polymerase beta subunit  35.06 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  40.26 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  43.21 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  36.26 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  35.8 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  32.98 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  34.07 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0052  DNA polymerase beta subunit  35.8 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0550488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2704  DNA polymerase beta domain-containing protein region  38.82 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.272306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  35.48 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  38.1 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  33.68 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  38.36 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  37.65 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0374  DNA polymerase beta subunit  38.96 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.509035  normal  0.373075 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  38.36 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  34.88 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2532  DNA polymerase beta subunit  35.16 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  39.02 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  35.23 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  38.67 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  32.05 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2529  DNA polymerase beta subunit  34.07 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0017  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  40.86 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.378069  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0168  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  40.86 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.172039  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1512  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  34.38 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0340826  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  32.98 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  34.48 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  34.48 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1652  ISSo9, nucleotidyltransferase domain-containing protein  34.78 
 
 		 69 aa  52.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.175672 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  31.91 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  34.78 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  37.84 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>