More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4146 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 339 aa  679    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  78.35 
 
 		 331 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2965  hypothetical protein  56.67 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  54.79 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  56.51 
 
 		 325 aa  335  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  54.49 
 
 		 326 aa  335  7e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  51.96 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  51.51 
 
 		 333 aa  332  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  50.62 
 
 		 322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  51.45 
 
 		 314 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  49.18 
 
 		 349 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  50.64 
 
 		 333 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  47.19 
 
 		 339 aa  308  9e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2068  hypothetical protein  47.87 
 
 		 342 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.233928  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  46.86 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  48.78 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  47.44 
 
 		 333 aa  289  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  49.54 
 
 		 330 aa  288  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  49.24 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  45.85 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  45.06 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  48.36 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44 
 
 		 327 aa  276  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  43.03 
 
 		 333 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.69 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.99 
 
 		 344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  43.08 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  48.47 
 
 		 349 aa  272  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  46.08 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  45.9 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  45.4 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  47.16 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  47.16 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  45.43 
 
 		 371 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  42.25 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  46.86 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  44.88 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5000  hypothetical protein  47.84 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  47.64 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  41.05 
 
 		 325 aa  266  5e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  45.08 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.5 
 
 		 336 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  44.78 
 
 		 332 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.41 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  46.01 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  44.79 
 
 		 348 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.41 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  46.31 
 
 		 338 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  45.3 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.32 
 
 		 345 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.16 
 
 		 345 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  46.3 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  45.68 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  42.28 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.78 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  44.37 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  43.19 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  48.84 
 
 		 323 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.52 
 
 		 330 aa  258  8e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  46.49 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  44.52 
 
 		 323 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.57 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.51 
 
 		 339 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.73 
 
 		 360 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  48.97 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.28 
 
 		 335 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.31 
 
 		 328 aa  257  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  44.55 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  44.16 
 
 		 329 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.28 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  42.3 
 
 		 327 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  43.14 
 
 		 355 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  44.37 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  45.58 
 
 		 339 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  44.33 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0645  hypothetical protein  46.98 
 
 		 331 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.77 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  44.34 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  42.9 
 
 		 327 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  42.51 
 
 		 331 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  42.51 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  44.13 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  43.85 
 
 		 324 aa  253  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  42.67 
 
 		 324 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  41.72 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  41.41 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  43.48 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.19 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.19 
 
 		 344 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.06 
 
 		 326 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.18 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  44.92 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.39 
 
 		 339 aa  249  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  42.51 
 
 		 328 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0911  hypothetical protein  44.86 
 
 		 338 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  42.45 
 
 		 321 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  46.96 
 
 		 386 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.2 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  44.3 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  44.3 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>