More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3950 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3627  major facilitator transporter  84.1 
 
 		 436 aa  700    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.943352  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3950  major facilitator protein family permease  100 
 
 		 436 aa  860    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6155  MFS family transporter  69.46 
 
 		 438 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000158885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70920  major facilitator transporter  69.7 
 
 		 438 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.23886  normal  0.150917 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5616  general substrate transporter  68.76 
 
 		 432 aa  608  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68439  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5488  major facilitator family transporter  69.76 
 
 		 445 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5042  major facilitator transporter  70 
 
 		 429 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5379  major facilitator transporter  69.05 
 
 		 429 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5238  major facilitator transporter  68.81 
 
 		 429 aa  594  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.18052  normal  0.198846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5330  major facilitator family transporter  68.81 
 
 		 429 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0357971  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4664  major facilitator transporter  68.82 
 
 		 435 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202429  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0144  major facilitator transporter  68.57 
 
 		 429 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2072  major facilitator family transporter  71.98 
 
 		 466 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264718  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50610  General substrate transporter  69.14 
 
 		 436 aa  580  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0875  major facilitator family transporter  72.46 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4557  major facilitator superfamily MFS_1  69.81 
 
 		 433 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1424  major facilitator family transporter  72.46 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0564  major facilitator family transporter  72.46 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2190  major facilitator family transporter  72.46 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0466  major facilitator family transporter  72.46 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596732  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1881  major facilitator family transporter  72.22 
 
 		 465 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0871  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  69.32 
 
 		 433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.464364 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0690  major facilitator transporter  66.43 
 
 		 435 aa  567  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00769628  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5198  major facilitator transporter  69.71 
 
 		 436 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.721044  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4670  major facilitator transporter  69.47 
 
 		 436 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.637276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4959  major facilitator transporter  68.99 
 
 		 461 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5310  major facilitator transporter  68.75 
 
 		 458 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3597  major facilitator transporter  63.89 
 
 		 462 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3057  major facilitator transporter  68.75 
 
 		 458 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0800  major facilitator transporter  65.87 
 
 		 466 aa  555  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  normal  0.0752982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3413  major facilitator transporter  69.01 
 
 		 436 aa  554  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.590366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0337  major facilitator transporter  68.75 
 
 		 435 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3469  major facilitator transporter  63.89 
 
 		 459 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00699451  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0572  major facilitator transporter  66.67 
 
 		 433 aa  551  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0579  major facilitator superfamily MFS_1  63.25 
 
 		 437 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.422736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0540  major facilitator superfamily MFS_1  63.25 
 
 		 445 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6481  major facilitator transporter  63.92 
 
 		 442 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0229436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1159  major facilitator transporter  59.58 
 
 		 435 aa  519  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5728  major facilitator transporter  63.68 
 
 		 442 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.815248  normal  0.706105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3856  major facilitator superfamily MFS_1  63.1 
 
 		 445 aa  511  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3661  major facilitator superfamily MFS_1  63.42 
 
 		 445 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1184  major facilitator superfamily MFS_1  63.35 
 
 		 447 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1058  major facilitator superfamily transporter  60.93 
 
 		 442 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.861696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5507  major facilitator transporter  59.61 
 
 		 441 aa  491  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352924 
 
 
-
 
NC_004310  BR1680  major facilitator family transporter  55.43 
 
 		 476 aa  484  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.311406  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1624  major facilitator family transporter  55.43 
 
 		 476 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.412047  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5753  MFS permease  57.35 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1267  major facilitator transporter  55.24 
 
 		 487 aa  478  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0311  major facilitator superfamily MFS_1  51.54 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0767  major facilitator superfamily MFS_1  57.54 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.747489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00802  prop transport protein  55.35 
 
 		 387 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0278837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1612  major facilitator family transporter  53.67 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3768  major facilitator transporter  50.98 
 
 		 438 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4767  general substrate transporter  52.17 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3530  major facilitator transporter  51.89 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0147  putative transporter, major facilitator superfamily  44.88 
 
 		 436 aa  362  9e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0277  major facilitator superfamily protein  45.57 
 
 		 436 aa  359  5e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0300  major facilitator superfamily protein  45.69 
 
 		 436 aa  359  7e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0248  major facilitator superfamily protein  45.69 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3778  major facilitator transporter  50.71 
 
 		 441 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4206  major facilitator family transporter  50.94 
 
 		 441 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0089  conserved hypothetical protein, probable MFS transporter  46.92 
 
 		 429 aa  355  8.999999999999999e-97  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.964688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1647  major facilitator transporter  50.71 
 
 		 441 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0539  major facilitator superfamily protein  42.09 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.956103  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1576  proline/betaine transporter, putative, authentic frameshift  38.48 
 
 		 431 aa  313  5.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1000  CjaB protein  38.44 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1063  transport protein CjaB  38.04 
 
 		 415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0025  major facilitator family transporter  39.34 
 
 		 438 aa  280  4e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2153  proline/betaine transporter  39.34 
 
 		 443 aa  279  7e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.877482  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0694  major facilitator family transporter CjaB  38.37 
 
 		 407 aa  279  9e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0796  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 433 aa  256  7e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0790  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 433 aa  254  3e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5160  major facilitator superfamily MFS_1  34.8 
 
 		 444 aa  247  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0903  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.77 
 
 		 443 aa  242  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760701  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6582  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 433 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512331  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0989  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.7 
 
 		 439 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1453  general substrate transporter  31.86 
 
 		 482 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0358051  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1522  major facilitator superfamily metabolite (proline/betaine)/H(+) symporter  35.21 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00301403  normal  0.935077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0930  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 448 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1693  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5767  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 438 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6600  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 434 aa  223  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1733  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 435 aa  222  9e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.32022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  35.52 
 
 		 440 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.52 
 
 		 440 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3666  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.262449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3304  General substrate transporter  34.38 
 
 		 456 aa  219  8.999999999999998e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2063  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 444 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 440 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2738  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  31.25 
 
 		 485 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2237  general substrate transporter  33.67 
 
 		 444 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3055  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 485 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3018  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 485 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2807  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2757  glycine betaine/L-proline ABC transporter, permease  31.25 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000489566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3017  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2222  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000297213 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3020  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3056  major facilitator superfamily protein superfamily  31.25 
 
 		 485 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.150401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>