More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2750 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  100 
 
 		 387 aa  766    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0003  DNA replication and repair protein RecF  38.19 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0003  DNA replication and repair protein RecF  38.98 
 
 		 363 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.31 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0003  DNA replication and repair protein RecF  35.42 
 
 		 363 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.222725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3886  DNA replication and repair protein RecF  34.93 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0534  DNA replication and repair protein RecF  34.38 
 
 		 367 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921957  hitchhiker  0.00000000241058 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  35.41 
 
 		 369 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5508  DNA replication and repair protein RecF  32.63 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0398  recF protein  32.1 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.33 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0749386  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0004  recombination protein F  32.98 
 
 		 374 aa  202  7e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.60396e-25 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.01 
 
 		 373 aa  202  8e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0004  recombination protein F  32.1 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.177605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  33.07 
 
 		 369 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09773  putative DNA replication and repair protein  31.62 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.753312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0004  recombination protein F  31.56 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.864622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0004  recombination protein F  31.56 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0004  recombination protein F  31.56 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000104808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0004  recombination protein F  31.56 
 
 		 375 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00277064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0004  recombination protein F  31.56 
 
 		 375 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0004  recombination protein F  31.56 
 
 		 375 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  30.53 
 
 		 374 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0004  recombination protein F  31.56 
 
 		 375 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.340003 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0004  recombination protein F  31.56 
 
 		 375 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5316  recombination protein F  31.64 
 
 		 375 aa  196  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0155044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1183  DNA replication and repair protein RecF  33.24 
 
 		 373 aa  196  8.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00164356  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0004  recombination protein F  31.92 
 
 		 370 aa  195  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.188075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0004  recombination protein F  31.92 
 
 		 370 aa  195  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.320094  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2550  recombination protein F  32.68 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0191996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0004  recombination protein F  32.01 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1772  DNA replication and repair protein RecF  35.26 
 
 		 371 aa  192  6e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0498  hypothetical protein  32.11 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3717  DNA replication and repair protein  29.87 
 
 		 377 aa  192  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  32.11 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  30.16 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0003  RecF protein  34.75 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.056932  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.87 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.780515  decreased coverage  0.00205006 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0004  recombination protein F  32.64 
 
 		 374 aa  188  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0434  DNA replication and repair protein RecF  36.44 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1991  recombination protein F  31.68 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0004  recombination protein F  30.09 
 
 		 362 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00040  DNA replication and repair protein RecF  32.11 
 
 		 375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.89 
 
 		 365 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.390569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0005  DNA replication and repair protein RecF  37.46 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000369508  hitchhiker  0.000000145417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2436  DNA replication and repair protein RecF  36.32 
 
 		 398 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.532549  normal  0.0198697 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0004  recombination protein F  31.58 
 
 		 374 aa  179  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00040  recombination protein F  36.22 
 
 		 390 aa  179  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000332989  normal  0.373412 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0003  recombination protein F  31.23 
 
 		 364 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0004  recombination protein F  36.15 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0214  DNA replication and repair protein RecF  29.58 
 
 		 359 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613838  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0003  recombination protein F  35.31 
 
 		 371 aa  176  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0004  DNA replication and repair protein RecF  37.87 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0004  recombination protein F  33.43 
 
 		 371 aa  176  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.106759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2156  recombination protein F  30.34 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000779125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0004  DNA replication and repair protein RecF  31.25 
 
 		 360 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  31.55 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0004  DNA replication and repair protein RecF  32.41 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00780262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.89 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.332828  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2238  recombination protein F  30.45 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.41 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00040  DNA replication and repair protein RecF  35.5 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5456  DNA replication and repair protein RecF  32.01 
 
 		 360 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  26.32 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  26.32 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0004  recombination protein F  36.59 
 
 		 377 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0533102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.64 
 
 		 364 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3391  recombination protein F  35.06 
 
 		 376 aa  166  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0004  recombination protein F  36.26 
 
 		 371 aa  166  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00656338  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1725  recombination protein F  33.93 
 
 		 390 aa  166  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0003  DNA replication and repair protein RecF  38.34 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0003  DNA replication and repair protein RecF  36.22 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0003  recombination protein F  31.84 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0004  DNA replication and repair protein RecF  36.36 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0003  DNA replication and repair protein RecF  38.08 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0005  recombination protein F  36.69 
 
 		 377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000288317  hitchhiker  0.00404548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.24 
 
 		 397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0003  recombination protein F  33.16 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.715959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.62 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321306  normal  0.933031 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0003  DNA replication and repair protein RecF  26.91 
 
 		 362 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000115018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  28.53 
 
 		 376 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00030  DNA replication and repair protein RecF  36.93 
 
 		 404 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.42 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2214  DNA replication and repair protein RecF  34.83 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0005  Recombinational DNA repair ATPase (RecF pathway)- like protein  32.04 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.6 
 
 		 358 aa  159  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0003  DNA replication and repair protein RecF  33.68 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.447101  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0005  DNA replication and repair protein RecF  34.62 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0824  recombination protein F  33.15 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  32.41 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0004  recombination protein F  33.43 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0004  recombination protein F  33.43 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0004  recombination protein F  35.57 
 
 		 376 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366352  unclonable  0.0000000175389 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0012  recombination protein F  33.43 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00030  DNA replication and repair protein RecF  31.63 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0004  recombination protein F  33.43 
 
 		 386 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187663 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0003  DNA replication and repair protein RecF  30.95 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000951254  normal  0.107465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0004  recombination protein F  32 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0003  recombination protein F  31.49 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0004  DNA replication and repair protein RecF  33.78 
 
 		 401 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0234523  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>