More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0728 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 209 aa  413  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  50.24 
 
 		 236 aa  201  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  53.66 
 
 		 263 aa  188  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  49.4 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  49.04 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  50.5 
 
 		 229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  40.93 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  48.08 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  50.49 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  41.78 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  51.16 
 
 		 229 aa  154  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  48.74 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  42.78 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  45.54 
 
 		 227 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  43.56 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  45.63 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  40.67 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  40.67 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  49.4 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  41.79 
 
 		 215 aa  147  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  46.31 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  45.14 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  43.84 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  40.44 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  48.89 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  46.59 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  43.17 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  40.1 
 
 		 219 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  40.1 
 
 		 219 aa  131  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  40.98 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  53.04 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  45.81 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  40.36 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  39.76 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  42.13 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  42.78 
 
 		 224 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  43.87 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  48.82 
 
 		 319 aa  125  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  37.44 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  40.59 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  47.79 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  40.59 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  40.59 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  40.59 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  40.59 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  45.59 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  37.02 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  48.28 
 
 		 344 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  50.88 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  48.28 
 
 		 344 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  48.28 
 
 		 344 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.5 
 
 		 345 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  39.6 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  37.75 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  48.25 
 
 		 219 aa  118  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  44.06 
 
 		 222 aa  117  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  38.27 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  42.96 
 
 		 261 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  42.96 
 
 		 261 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  47.37 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  47.37 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  44.85 
 
 		 216 aa  115  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  40.97 
 
 		 218 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  42.14 
 
 		 182 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  46.55 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  38.22 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  45.69 
 
 		 344 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  45.3 
 
 		 214 aa  114  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  53.21 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  42.7 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  39.33 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  51.49 
 
 		 320 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  46.43 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  57.73 
 
 		 321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  46.32 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  44.09 
 
 		 296 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  44.85 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  50.46 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  41.09 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  39.86 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  44.83 
 
 		 344 aa  112  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  53 
 
 		 447 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  44.83 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  45.65 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  41.18 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  52.94 
 
 		 331 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>