More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3447 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  100 
 
 
332 aa  678    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  97.29 
 
 
332 aa  663    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2355  ABC transporter related  81.93 
 
 
333 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297181  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  77.64 
 
 
332 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3796  ABC transporter related  79.52 
 
 
332 aa  537  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2460  ABC transporter related  74.7 
 
 
336 aa  521  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  73.8 
 
 
332 aa  511  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  72.89 
 
 
332 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  72.89 
 
 
332 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  73.19 
 
 
332 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  71.99 
 
 
332 aa  500  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4842  ABC transporter related  74.47 
 
 
332 aa  494  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2905  ABC transporter related  70.87 
 
 
334 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.125819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  70.57 
 
 
334 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  68.07 
 
 
338 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  70.24 
 
 
334 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  69.07 
 
 
335 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3550  ABC transporter related  60.84 
 
 
333 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3400  ABC transporter related  63.25 
 
 
336 aa  435  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  61.14 
 
 
333 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2642  ABC transporter related  61.66 
 
 
334 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00146176  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  61.45 
 
 
333 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  60.18 
 
 
333 aa  428  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2902  ABC transporter related  61.04 
 
 
333 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  60.24 
 
 
338 aa  409  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2943  ABC transporter related  59.76 
 
 
333 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  58.06 
 
 
372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0307  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.86 
 
 
333 aa  403  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.216758  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6535  ABC transporter related  59.38 
 
 
325 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0162268 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0282  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  58.56 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.911621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  56.08 
 
 
370 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0022  ABC transporter related  58.56 
 
 
342 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.51164  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27370  ATP-binding protein of mannitol ABC transporter  55.9 
 
 
369 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5605  ABC transporter related  59.08 
 
 
325 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.73396  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  56.67 
 
 
368 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  55.8 
 
 
370 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4471  ABC transporter related  56.55 
 
 
367 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.571235  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  56.35 
 
 
370 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  56.93 
 
 
332 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6094  ABC transporter related  59.7 
 
 
333 aa  388  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3809  ABC transporter related  56.93 
 
 
342 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  57.27 
 
 
334 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5494  ABC transporter related  55.86 
 
 
341 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0266048 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  52.54 
 
 
359 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1357  ABC transporter related  59.48 
 
 
349 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237797  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.77 
 
 
365 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  54.6 
 
 
375 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4322  ABC transporter related protein  53.95 
 
 
378 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1648  ABC transporter related  52.09 
 
 
371 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.783351 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  56.27 
 
 
333 aa  371  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  53.93 
 
 
359 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  54.17 
 
 
368 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  55.03 
 
 
395 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  57.41 
 
 
369 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2007  ABC transporter related  53.67 
 
 
367 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0636  ABC transporter related  54.47 
 
 
380 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2614  ABC transporter related  54.75 
 
 
376 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2011  ABC transporter ATP-binding protein  54.6 
 
 
361 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0583753  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  56.78 
 
 
369 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  57.1 
 
 
338 aa  364  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  53.87 
 
 
354 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.78 
 
 
369 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3912  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.04 
 
 
369 aa  362  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31471  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0308  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.04 
 
 
369 aa  362  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5760  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  53.82 
 
 
372 aa  362  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  52.94 
 
 
366 aa  362  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  53.65 
 
 
359 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0380  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  54.04 
 
 
369 aa  362  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  52.66 
 
 
361 aa  361  8e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  54.65 
 
 
344 aa  360  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5080  ABC transporter related  53.61 
 
 
368 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199927 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  51.38 
 
 
369 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  56.17 
 
 
330 aa  360  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  51.38 
 
 
369 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3776  ABC transporter related  51.55 
 
 
360 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429106  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4348  ABC transporter related  55.46 
 
 
358 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012327 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  52.38 
 
 
361 aa  359  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  52.69 
 
 
364 aa  359  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  51.1 
 
 
369 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  52.08 
 
 
371 aa  359  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1111  ABC transporter related  54.49 
 
 
345 aa  358  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0063  ABC transporter related  52.82 
 
 
364 aa  358  5e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  53.61 
 
 
360 aa  358  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  52.72 
 
 
352 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0135  ABC transporter-related protein  54.57 
 
 
350 aa  358  6e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.370225 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  53.07 
 
 
365 aa  358  6e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2522  ABC transporter-related protein  53.8 
 
 
391 aa  358  7e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  54 
 
 
361 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  53.61 
 
 
360 aa  357  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0851  ABC transporter related  51.54 
 
 
368 aa  357  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.236599 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  51.1 
 
 
369 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  55.33 
 
 
352 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  54.89 
 
 
351 aa  358  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4019  ABC transporter related  55.18 
 
 
358 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  51.38 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  51.38 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  50.83 
 
 
369 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  50 
 
 
381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  55.62 
 
 
357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  52.42 
 
 
359 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>