More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3103 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  95.71 
 
 		 513 aa  980    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 513 aa  1024    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.19 
 
 		 526 aa  531  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.26 
 
 		 508 aa  531  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.17 
 
 		 527 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.97 
 
 		 527 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.41 
 
 		 520 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.21 
 
 		 518 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0683738  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.5 
 
 		 513 aa  511  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.7 
 
 		 520 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.3 
 
 		 501 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.3 
 
 		 512 aa  504  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.09 
 
 		 511 aa  504  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.07 
 
 		 512 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.08 
 
 		 512 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.9 
 
 		 509 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.9 
 
 		 532 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.38 
 
 		 507 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  51.66 
 
 		 534 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.68 
 
 		 507 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  50.49 
 
 		 507 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  51.74 
 
 		 514 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.51 
 
 		 493 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.5 
 
 		 513 aa  481  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.21 
 
 		 512 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.66 
 
 		 508 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.3 
 
 		 516 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  49.3 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.5 
 
 		 511 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  49.1 
 
 		 511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.36 
 
 		 524 aa  464  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.27 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.29 
 
 		 529 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.04 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  40.04 
 
 		 561 aa  365  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40 
 
 		 511 aa  365  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.94 
 
 		 521 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.43 
 
 		 517 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.61 
 
 		 517 aa  360  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39 
 
 		 515 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.29 
 
 		 537 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.45 
 
 		 515 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2190  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.48 
 
 		 514 aa  349  7e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.17 
 
 		 530 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.5 
 
 		 532 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3092  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.22 
 
 		 506 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3532  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.98 
 
 		 500 aa  336  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204576  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.24 
 
 		 510 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.24 
 
 		 503 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.6 
 
 		 530 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0882  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.19 
 
 		 539 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0688  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  38.19 
 
 		 539 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957167  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0470  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  38.19 
 
 		 539 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1406  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  38.19 
 
 		 539 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.728778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1622  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.99 
 
 		 539 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.99 
 
 		 539 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  37.99 
 
 		 539 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.17 
 
 		 526 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.85 
 
 		 534 aa  329  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06902  hypothetical protein  37.22 
 
 		 495 aa  329  9e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.66 
 
 		 534 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.23 
 
 		 520 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.04 
 
 		 529 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  36.53 
 
 		 496 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5244  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.95 
 
 		 522 aa  323  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3317  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.68 
 
 		 526 aa  322  7e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  36.79 
 
 		 526 aa  322  8e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.4 
 
 		 530 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.4 
 
 		 530 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.2 
 
 		 530 aa  319  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  36.36 
 
 		 526 aa  317  3e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2434  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.57 
 
 		 525 aa  317  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0104052 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.73 
 
 		 511 aa  316  8e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1747  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.83 
 
 		 509 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2091  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  35.83 
 
 		 509 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.18 
 
 		 519 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.15 
 
 		 532 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
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NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  37.14 
 
 		 525 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
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NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.16 
 
 		 529 aa  297  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.97 
 
 		 529 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.9 
 
 		 529 aa  295  9e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.85 
 
 		 531 aa  290  6e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_0562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.22 
 
 		 516 aa  289  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.9 
 
 		 554 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
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NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.45 
 
 		 536 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
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NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.93 
 
 		 528 aa  283  7.000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1292  multidrug resistance B (translocase) transmembrane protein  32.49 
 
 		 518 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453307  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.07 
 
 		 524 aa  279  7e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_3487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.94 
 
 		 511 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.02 
 
 		 519 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.47 
 
 		 519 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 519 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A0858  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.47 
 
 		 515 aa  277  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916368  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 519 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 519 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 519 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 519 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.2 
 
 		 523 aa  276  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 		 519 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.73 
 
 		 511 aa  276  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
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