44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2547 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  50.17 
 
 		 1246 aa  1157    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  94.51 
 
 		 1238 aa  2267    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  46.16 
 
 		 1230 aa  1001    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  100 
 
 		 1234 aa  2468    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  34.58 
 
 		 1273 aa  611  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  33.03 
 
 		 1247 aa  525  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1247 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  31.88 
 
 		 1278 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  24.45 
 
 		 1146 aa  170  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4017  AsmA family protein  23.92 
 
 		 1274 aa  154  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.43483  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0705  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1174 aa  148  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2736  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1275 aa  144  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.758351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6121  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1258 aa  144  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1421  AsmA family protein  24.32 
 
 		 1331 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2027  AsmA  24.11 
 
 		 1273 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156532  normal  0.201776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3363  AsmA  24.14 
 
 		 1308 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4952  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1146 aa  103  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000122886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2059  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1210 aa  96.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.888288  normal  0.0121954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0396  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1179 aa  95.1  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.568269  normal  0.674287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  29.01 
 
 		 1186 aa  95.1  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  22.57 
 
 		 1077 aa  93.6  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0365  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1175 aa  62.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0320  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1175 aa  62  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.831635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  24.19 
 
 		 656 aa  60.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  23.27 
 
 		 643 aa  60.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  26.4 
 
 		 602 aa  59.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3274  AsmA  23.29 
 
 		 1239 aa  55.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.564175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  24.45 
 
 		 709 aa  53.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  24.88 
 
 		 630 aa  52.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  25.62 
 
 		 667 aa  51.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  25.17 
 
 		 649 aa  50.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  24.16 
 
 		 656 aa  50.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  25.35 
 
 		 630 aa  50.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1785  hypothetical protein  25.4 
 
 		 470 aa  50.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  29.14 
 
 		 649 aa  49.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  29.7 
 
 		 818 aa  48.5  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1095 aa  47.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  23.56 
 
 		 656 aa  47.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  21.74 
 
 		 839 aa  46.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  24.68 
 
 		 697 aa  46.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3857  AsmA  24.6 
 
 		 862 aa  46.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  21.01 
 
 		 832 aa  45.8  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  21.37 
 
 		 645 aa  45.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  24.27 
 
 		 654 aa  45.1  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>