216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3528 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3528  patatin  100 
 
 		 420 aa  863    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  54.5 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  46.54 
 
 		 413 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1198  patatin  35.58 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  33.75 
 
 		 398 aa  216  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  36.29 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  34.82 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  33.68 
 
 		 411 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  31.45 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  25.62 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  28.51 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0999  patatin  27.67 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  28.52 
 
 		 748 aa  65.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  24.42 
 
 		 727 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  26.12 
 
 		 746 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  23.48 
 
 		 740 aa  64.3  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  26.94 
 
 		 728 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  26.12 
 
 		 728 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  26.12 
 
 		 751 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  28.95 
 
 		 728 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  24.54 
 
 		 736 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  24.16 
 
 		 739 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  23.79 
 
 		 738 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  23.79 
 
 		 738 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  23.16 
 
 		 720 aa  59.7  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  24.93 
 
 		 767 aa  59.7  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  26.4 
 
 		 741 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  27.59 
 
 		 728 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  25.12 
 
 		 735 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  33.08 
 
 		 933 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  33.08 
 
 		 920 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  26.94 
 
 		 733 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  23.58 
 
 		 740 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  33.08 
 
 		 945 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  33.08 
 
 		 930 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  33.08 
 
 		 728 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  27.48 
 
 		 796 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  33.08 
 
 		 714 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  28.86 
 
 		 263 aa  56.2  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  27.95 
 
 		 389 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  31.79 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  26.98 
 
 		 803 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  26.98 
 
 		 803 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  26.98 
 
 		 803 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  37.76 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  26.96 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1321  patatin  23.47 
 
 		 253 aa  55.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  26.74 
 
 		 798 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  29.08 
 
 		 296 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  26.36 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  31.54 
 
 		 852 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  35.51 
 
 		 333 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  26.36 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  26.36 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  26.36 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  26.36 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  26.36 
 
 		 390 aa  53.9  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  26.62 
 
 		 804 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  26.77 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  26.79 
 
 		 707 aa  53.9  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  27.27 
 
 		 728 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  31.48 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  26.36 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  24.9 
 
 		 733 aa  53.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.4 
 
 		 760 aa  53.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  31.54 
 
 		 813 aa  53.5  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0408  Patatin  26.64 
 
 		 256 aa  53.1  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.129061  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20180  hypothetical protein  31.33 
 
 		 376 aa  53.1  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.88981  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  26.09 
 
 		 737 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  23.66 
 
 		 738 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  25.83 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  26.09 
 
 		 738 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  25.2 
 
 		 777 aa  52.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  25.13 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  25.21 
 
 		 751 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  27.62 
 
 		 319 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  34.09 
 
 		 305 aa  51.6  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  31.96 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  25.31 
 
 		 753 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  47.06 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  30.94 
 
 		 327 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  26.78 
 
 		 737 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  25.69 
 
 		 738 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  27.19 
 
 		 324 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  24.8 
 
 		 667 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  25.19 
 
 		 738 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  25.83 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  25.85 
 
 		 390 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  25.59 
 
 		 750 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  26.69 
 
 		 277 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  31.25 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  30.93 
 
 		 276 aa  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  26.64 
 
 		 318 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  29.82 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  44.07 
 
 		 368 aa  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0469  hypothetical protein  24.02 
 
 		 276 aa  50.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  29.67 
 
 		 316 aa  49.7  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  29.67 
 
 		 316 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  37 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  28.7 
 
 		 745 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>