130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5263 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0621  hypothetical protein  77.06 
 
 
218 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0550571 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3647  hypothetical protein  34.74 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  34.31 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0173  hypothetical protein  33.65 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0801  hypothetical protein  33.66 
 
 
228 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0729  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  92.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2508  hypothetical protein  32.85 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0780  hypothetical protein  34.17 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3258  hypothetical protein  30.95 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  37.31 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  31.22 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6671  hypothetical protein  28.43 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.133048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2263  hypothetical protein  33.85 
 
 
237 aa  72  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  37.59 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  30.11 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  30.11 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  30.11 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0441  hypothetical protein  32.83 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31423  normal  0.269531 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2643  hypothetical protein  32.83 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0463  hypothetical protein  32.83 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  37.4 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3030  hypothetical protein  34.15 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0398  hypothetical protein  32.32 
 
 
260 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  35.11 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1786  hypothetical protein  28.86 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.695927  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  35.88 
 
 
261 aa  62  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  26.19 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  38.89 
 
 
262 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  35.88 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  35.88 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2979  hypothetical protein  32.82 
 
 
329 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000658806 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  37.93 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1603  hypothetical protein  23.92 
 
 
225 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1182  putative type VI secretion protein VasF-1  27.61 
 
 
374 aa  58.5  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.29093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0154  hypothetical protein  24.64 
 
 
229 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0130  hypothetical protein  25.12 
 
 
229 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  30.81 
 
 
405 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  27.51 
 
 
282 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  27.81 
 
 
290 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0119  hypothetical protein  25.71 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  29.57 
 
 
282 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  32.82 
 
 
260 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  28.81 
 
 
282 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.41 
 
 
327 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  25.58 
 
 
429 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  25.73 
 
 
289 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  24.86 
 
 
257 aa  52  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  25.73 
 
 
289 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  33.33 
 
 
241 aa  51.6  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  26.82 
 
 
430 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  29.31 
 
 
594 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  25.58 
 
 
289 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  26.32 
 
 
310 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  30.52 
 
 
271 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  30.14 
 
 
463 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  24.31 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  29.13 
 
 
433 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  27.53 
 
 
289 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  27.53 
 
 
289 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3403  hypothetical protein  37.84 
 
 
254 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  21.23 
 
 
255 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  21.23 
 
 
255 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  28.47 
 
 
291 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  28.47 
 
 
291 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  26.06 
 
 
404 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  28.68 
 
 
293 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  26.14 
 
 
453 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  30.09 
 
 
290 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  28.45 
 
 
571 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  32.53 
 
 
433 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  28.45 
 
 
571 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  35.56 
 
 
226 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50770  hypothetical protein  36.17 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.203271  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  26.54 
 
 
434 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  28.45 
 
 
552 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  28.45 
 
 
560 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  31.9 
 
 
453 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  32.53 
 
 
433 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  28.45 
 
 
552 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  32.53 
 
 
433 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  28.45 
 
 
552 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  28.45 
 
 
552 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3165  hypothetical protein  34.48 
 
 
264 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  28.95 
 
 
426 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1716  hypothetical protein  36.17 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  28.95 
 
 
421 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5995  hypothetical protein  34.04 
 
 
250 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  28.21 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  28.95 
 
 
421 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0164  hypothetical protein  41.07 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.431152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  28.95 
 
 
421 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  23.97 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  28.95 
 
 
421 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  28.95 
 
 
421 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  28.95 
 
 
421 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  23.62 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  23.97 
 
 
252 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  31.91 
 
 
436 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>