161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1735 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  973    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  63.37 
 
 		 480 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  35.43 
 
 		 484 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  34.68 
 
 		 499 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  35 
 
 		 499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  34.89 
 
 		 502 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  34.78 
 
 		 484 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  34.78 
 
 		 484 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  34.78 
 
 		 484 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  34.46 
 
 		 507 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  34.26 
 
 		 507 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  32.21 
 
 		 488 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  34.14 
 
 		 507 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  34.14 
 
 		 507 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  35.89 
 
 		 485 aa  266  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  34.1 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  35.95 
 
 		 485 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  28.4 
 
 		 790 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 790 aa  156  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 791 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  24.6 
 
 		 546 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  25.5 
 
 		 824 aa  123  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  28.16 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2804  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 		 598 aa  81.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  23.4 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  23 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  23 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  23.49 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  24.22 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  20.82 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  20.82 
 
 		 488 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  20.39 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  21.24 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  26.25 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  25.36 
 
 		 582 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  22.57 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  22.45 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  21.67 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2971  serine/threonine protein kinase-like protein  30.3 
 
 		 586 aa  67.4  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  25.63 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  25.87 
 
 		 352 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  21.82 
 
 		 491 aa  67  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 		 279 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  25.28 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  23.88 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  25.38 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  27.88 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  22.22 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  28.28 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  26.35 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  24.09 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  24.09 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1977  putative signal transduction protein  25 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  24.26 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.67 
 
 		 634 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  21.12 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  20.6 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  26.86 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  20.74 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  24.74 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  23.4 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  29.66 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  25.27 
 
 		 716 aa  57.4  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  20.26 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  24.14 
 
 		 283 aa  57  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.12 
 
 		 632 aa  56.6  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  20.69 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  22.2 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  25.37 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  24.06 
 
 		 281 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  21.39 
 
 		 412 aa  56.6  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  23.4 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 		 284 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  22.34 
 
 		 303 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  26.19 
 
 		 284 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  23.04 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  21.05 
 
 		 298 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  20.2 
 
 		 283 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  21.28 
 
 		 287 aa  54.7  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  24.76 
 
 		 274 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  24.76 
 
 		 274 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 		 292 aa  54.7  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 		 397 aa  54.3  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 		 285 aa  54.3  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  24.86 
 
 		 284 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  28.89 
 
 		 302 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  23.81 
 
 		 280 aa  53.9  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  24.76 
 
 		 274 aa  53.9  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  27.46 
 
 		 289 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  24.75 
 
 		 274 aa  53.5  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  20.63 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  30.98 
 
 		 285 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  27.17 
 
 		 284 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  26.02 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>