More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2080 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  100 
 
 		 108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  91.59 
 
 		 108 aa  201  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  88.89 
 
 		 108 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2103  rhodanese-like protein  86.11 
 
 		 108 aa  186  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.588432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  87.38 
 
 		 107 aa  182  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1499  rhodanese-like protein  81.55 
 
 		 111 aa  174  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  80.58 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2590  rhodanese domain-containing protein  54.29 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2475  rhodanese domain-containing protein  56.44 
 
 		 108 aa  110  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  50.49 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1618  rhodanese domain-containing protein  48.48 
 
 		 175 aa  98.2  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.576106 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  46 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  45.54 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  47.31 
 
 		 185 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  46.23 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3723  rhodanese domain-containing protein  44.12 
 
 		 112 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.464029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  46.23 
 
 		 107 aa  83.6  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  46.23 
 
 		 107 aa  83.6  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  44.55 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0154  rhodanese domain-containing protein  44.71 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1792  rhodanese-like protein  44.76 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0775  Rhodanese domain protein  37.74 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  40.78 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  40.4 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1431  rhodanese domain-containing protein  41.96 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.430812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0487  Rhodanese domain protein  33.96 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1190  Rhodanese domain protein  37.61 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1330  rhodanese domain-containing protein  42.42 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.434015 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  38.1 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  37.76 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 		 271 aa  67  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  40.62 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  40.62 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  39.05 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2860  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  40.62 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2024  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0112  rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00002113  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0463  rhodanese domain-containing protein  34.62 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000512984  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5070  rhodanese domain-containing protein  40.59 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.34245  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  39.8 
 
 		 216 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  43.9 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1183  rhodanese-like protein  36.19 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  37.93 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0533  rhodanese-like protein  33.01 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298777  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  43.01 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  35.78 
 
 		 277 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  38.39 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2978  hypothetical protein  39.39 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.1375 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2995  inner membrane protein YgaP  39.39 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  0.0280507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2911  inner membrane protein YgaP  39.39 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  33.68 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1937  rhodanese-like protein  40.7 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.66 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3100  inner membrane protein YgaP  39.39 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.5055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  29.13 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2943  inner membrane protein YgaP  38.38 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.143183 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  35.48 
 
 		 386 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  32.67 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  35.64 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05040  endoplasmic reticulum protein, putative  37.78 
 
 		 179 aa  57  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.575301  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  36.14 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  40.24 
 
 		 389 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  36.54 
 
 		 460 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  32.61 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  29.46 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  39.29 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  32 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.48 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0455  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  32.63 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0794  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase/rhodanese domain-containing protein  32.65 
 
 		 558 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  32.17 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1591  Rhodanese domain protein  37.62 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0149932  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  33.03 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  35.05 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.74 
 
 		 387 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3213  putative inner membrane protein  37.25 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3484  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.65 
 
 		 561 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2948  putative inner membrane protein  37.25 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3910  putative inner membrane protein  37.37 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.347321 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  39.51 
 
 		 390 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  38.95 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1308  Rhodanese domain protein  38 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1907  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.98 
 
 		 364 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  42.39 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0337  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.680282 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1015  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 320 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>