More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0020 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0020  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 697 aa  1377    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1361  AAA ATPase, central region  56.59 
 
 		 704 aa  702    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252526  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3656  AAA ATPase, central region  43.59 
 
 		 694 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1566  AAA ATPase central domain protein  35.25 
 
 		 625 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.20815  hitchhiker  0.00245284 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4675  ATPase central domain-containing protein  35.79 
 
 		 720 aa  231  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1816  ATPase central domain-containing protein  30.68 
 
 		 590 aa  213  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0985  AAA ATPase central domain protein  31.18 
 
 		 683 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130271 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5669  AAA ATPase central domain protein  31.68 
 
 		 699 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1202  ATPase central domain-containing protein  33.39 
 
 		 627 aa  200  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0870142  normal  0.869838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0194  AAA ATPase central domain protein  29.97 
 
 		 619 aa  180  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0808  ATPase central domain-containing protein  33.6 
 
 		 715 aa  167  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1422  ATPase central domain-containing protein  33.6 
 
 		 715 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3837  AAA ATPase central domain protein  33.88 
 
 		 715 aa  157  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.79 
 
 		 602 aa  135  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.25 
 
 		 676 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  28.71 
 
 		 692 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.24 
 
 		 651 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0293  FtsH peptidase  29.05 
 
 		 640 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09651  FtsH ATP-dependent protease-like protein  29.52 
 
 		 640 aa  131  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.116112  normal  0.424003 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.32 
 
 		 628 aa  131  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.185769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3197  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.79 
 
 		 647 aa  130  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1738  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.32 
 
 		 628 aa  130  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83044  normal  0.291569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  28.54 
 
 		 627 aa  130  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.46 
 
 		 639 aa  130  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1599  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.99 
 
 		 647 aa  130  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.238697 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.5 
 
 		 610 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0632  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.88 
 
 		 683 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.55 
 
 		 637 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.698046  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_002978  WD1253  cell division protein FtsH  27.29 
 
 		 613 aa  129  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.44 
 
 		 640 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.44 
 
 		 640 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1098  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.57 
 
 		 610 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0627303  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0535  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.15 
 
 		 627 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000788844  unclonable  0.00000000175333 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.5 
 
 		 610 aa  128  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  27.57 
 
 		 611 aa  128  3e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.44 
 
 		 696 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.81 
 
 		 616 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4594  FtsH peptidase  29.65 
 
 		 628 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  29.36 
 
 		 645 aa  127  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  27.93 
 
 		 691 aa  127  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  28.57 
 
 		 645 aa  127  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1034  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.82 
 
 		 510 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.31 
 
 		 638 aa  127  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  27.01 
 
 		 614 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.5 
 
 		 685 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.25 
 
 		 605 aa  126  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.38 
 
 		 638 aa  126  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.83 
 
 		 611 aa  126  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.37 
 
 		 651 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0253083  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  29.81 
 
 		 638 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3058  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.86 
 
 		 628 aa  126  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539417  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  26.54 
 
 		 663 aa  125  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.25 
 
 		 697 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2412  membrane protease FtsH catalytic subunit  30.29 
 
 		 628 aa  125  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.278023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  30.95 
 
 		 658 aa  125  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.5 
 
 		 621 aa  125  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.81 
 
 		 682 aa  124  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.919885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28 
 
 		 645 aa  124  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.06 
 
 		 652 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  29.08 
 
 		 640 aa  124  7e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.36 
 
 		 608 aa  124  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.12 
 
 		 636 aa  124  7e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08451  FtsH ATP-dependent protease-like protein  29 
 
 		 637 aa  124  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0508625  hitchhiker  0.00322552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.45 
 
 		 617 aa  124  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.86 
 
 		 638 aa  124  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  29.79 
 
 		 605 aa  124  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2786  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.55 
 
 		 601 aa  124  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35099  predicted protein  28.54 
 
 		 651 aa  123  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.235498  decreased coverage  0.000591243 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  26.59 
 
 		 673 aa  123  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  29.01 
 
 		 673 aa  123  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05140  ATPase, putative  28.77 
 
 		 817 aa  123  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0164604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3190  FtsH peptidase  29.38 
 
 		 628 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0440312  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.73 
 
 		 641 aa  123  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.51 
 
 		 634 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.64 
 
 		 638 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4374  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.5 
 
 		 618 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0172  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.47 
 
 		 646 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4241  FtsH-2 peptidase  30.43 
 
 		 621 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.41 
 
 		 638 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2472  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.32 
 
 		 601 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0326  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.64 
 
 		 681 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000432409  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.97 
 
 		 612 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.73 
 
 		 612 aa  122  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4390  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.21 
 
 		 623 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.489169  normal  0.114321 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  28.45 
 
 		 641 aa  121  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.42 
 
 		 673 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  31.55 
 
 		 630 aa  122  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0228  cell division protein FtsH2  28.27 
 
 		 617 aa  122  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.288231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.49 
 
 		 632 aa  122  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.79 
 
 		 636 aa  122  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.59 
 
 		 628 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.48 
 
 		 628 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  27.68 
 
 		 783 aa  121  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.72 
 
 		 628 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0630  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.72 
 
 		 628 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1112  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.75 
 
 		 653 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.322168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.47 
 
 		 642 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  28.45 
 
 		 648 aa  121  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  28.1 
 
 		 608 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0690  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.09 
 
 		 631 aa  121  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.827702  normal  0.407783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>