More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0859 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0859  thiolase  100 
 
 		 389 aa  801    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  53.52 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5282  hypothetical protein  49.23 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  38.11 
 
 		 390 aa  235  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2676  hypothetical protein  36.49 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  36.39 
 
 		 391 aa  212  9e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  36.57 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.77 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0031  hypothetical protein  34.09 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.761011  normal  0.262129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0041  hypothetical protein  34.09 
 
 		 402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0050  hypothetical protein  34.09 
 
 		 402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0851197  normal  0.0510911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  32.55 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  33.7 
 
 		 387 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  32.28 
 
 		 389 aa  176  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2151  nonspecific lipid-transfer protein  31.23 
 
 		 403 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4269  hypothetical protein  32.99 
 
 		 402 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340919  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  31.78 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  33.79 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  31.91 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3115  acetyl-CoA acetyltransferase  33.16 
 
 		 382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119662  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  32.22 
 
 		 380 aa  166  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  30.69 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.99 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2377  hypothetical protein  34.29 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 		 385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  33.14 
 
 		 390 aa  163  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.28 
 
 		 382 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  32.89 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.241671  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  30.65 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  30.77 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  29.55 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  32.8 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  32.71 
 
 		 381 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  31.9 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2663  acetyl-CoA acetyltransferase  33.94 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3874  hypothetical protein  31.61 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  32.73 
 
 		 386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  33.25 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5006  acetyl-CoA acetyltransferase  32.06 
 
 		 382 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  0.11432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.25 
 
 		 380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2350  acetyl-CoA acetyltransferase  33.42 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.731467  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.07 
 
 		 388 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  29.95 
 
 		 379 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  32.04 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  30.67 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  30.79 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  32.35 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  32.06 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.88 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  30.27 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.81 
 
 		 378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.32 
 
 		 384 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  33.04 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  32.71 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  32.17 
 
 		 383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  32.36 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  31.33 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  32.6 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  29.59 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1008  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.29 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  32.81 
 
 		 390 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  31.96 
 
 		 397 aa  149  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  30.22 
 
 		 383 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  32.19 
 
 		 382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  28.93 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0316  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-6)  30.77 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  31.27 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1757  acetyl-CoA acetyltransferase  31.73 
 
 		 391 aa  146  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439431  normal  0.143058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  34.09 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1502  acetyl-CoA acetyltransferase  31.58 
 
 		 390 aa  146  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  30.75 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  30.67 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5095  acetyl-CoA acetyltransferase  33.13 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.926475 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  32.03 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  31.94 
 
 		 389 aa  144  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  31.25 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1686  Acetyl-CoA acetyltransferase-like  31.78 
 
 		 379 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0569144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.65 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0855  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-10)  28.39 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0722065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  30.29 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4787  acetyl-CoA acetyltransferase  32.26 
 
 		 387 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0607631  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3805  acetyl-CoA acetyltransferase  32.54 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  31.07 
 
 		 394 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  31.22 
 
 		 402 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  32.37 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  31.06 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  31.12 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  29.89 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  32.73 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  31.99 
 
 		 395 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  31.96 
 
 		 384 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7411  acetyl-CoA acetyltransferase  29.53 
 
 		 383 aa  136  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4565  acetyl-CoA acetyltransferase  31.5 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153409  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  28.01 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  31.68 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  31.94 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  31.27 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  30.08 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  30.3 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>