More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2297 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  630  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  65.89 
 
 		 301 aa  443  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 301 aa  328  6e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 300 aa  325  7e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  48.17 
 
 		 300 aa  312  4.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 298 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  41.36 
 
 		 293 aa  242  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  37.62 
 
 		 307 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  38.49 
 
 		 303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4604  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3528  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  36.63 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.02 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 303 aa  228  9e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 304 aa  225  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 305 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 296 aa  221  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 305 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 305 aa  221  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1970  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 399 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.77 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3206  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2362  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4627  transcriptional regulator, LysR family  37.01 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397296  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  37.17 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 294 aa  215  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 306 aa  215  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  37.09 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4357  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  37.32 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4684  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.36 
 
 		 318 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  36.64 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02101  probable transcriptional regulator, LysR family protein  34.22 
 
 		 301 aa  208  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0550958  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 301 aa  208  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4262  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 350 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  34.58 
 
 		 289 aa  206  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  34.58 
 
 		 289 aa  206  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 307 aa  205  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 307 aa  205  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  34.36 
 
 		 289 aa  205  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 299 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 301 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1083  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  35.59 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1277  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.927239  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 302 aa  201  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1915  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0475  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5787  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  33.01 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>