89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1736 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  61.46 
 
 		 296 aa  368  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  61.11 
 
 		 296 aa  368  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  31.92 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  31.92 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  32.34 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  32.34 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  31.54 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  31.15 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  32.71 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  32.21 
 
 		 269 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  31.18 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  30.8 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  31.3 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  30.15 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  29.92 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  30.15 
 
 		 281 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  29.77 
 
 		 281 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  29.77 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  30.15 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  29.77 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  27.47 
 
 		 267 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  32.72 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  32.05 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  27.6 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  28.08 
 
 		 275 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  28.08 
 
 		 275 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  27.94 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  32.82 
 
 		 270 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  28.08 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  28.08 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  28.08 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  28.08 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  28.08 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 264 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 289 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  30.74 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  26.74 
 
 		 273 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  30.74 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  26.37 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  29.23 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  28.89 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  25.64 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  24.72 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  30.37 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  27.52 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  25.32 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  23.85 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67215  predicted protein  21.92 
 
 		 388 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.546499 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30500  predicted protein  20.34 
 
 		 390 aa  51.2  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.363686 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  22.3 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5930  hypothetical protein  35.48 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.615231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3330  phospholipase/carboxylesterase  28.28 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333713  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0068  Alpha/beta hydrolase fold  22.96 
 
 		 375 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>