More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0167 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 445 aa  902    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  66.28 
 
 		 434 aa  585  1e-166  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  67.44 
 
 		 433 aa  587  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  44.62 
 
 		 457 aa  322  9.000000000000001e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  46.17 
 
 		 470 aa  315  8e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  39.54 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  42.52 
 
 		 438 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  40.31 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  41.81 
 
 		 438 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  42.25 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  41.85 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  41.57 
 
 		 438 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  42.67 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  42.41 
 
 		 466 aa  295  9e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  39.19 
 
 		 415 aa  293  5e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  40.05 
 
 		 448 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  42.18 
 
 		 438 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  41.3 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  38.67 
 
 		 445 aa  289  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  41.58 
 
 		 514 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  38.43 
 
 		 445 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  41.69 
 
 		 430 aa  286  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  38.99 
 
 		 440 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  43.21 
 
 		 438 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  39.9 
 
 		 455 aa  286  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  41.84 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  43.41 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  42.22 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  40.82 
 
 		 432 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  38.7 
 
 		 424 aa  276  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  40.11 
 
 		 417 aa  275  8e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  41.55 
 
 		 411 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  40.39 
 
 		 409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  42.7 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  42.7 
 
 		 413 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  39.2 
 
 		 419 aa  260  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  41.64 
 
 		 429 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  40.88 
 
 		 429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  39.18 
 
 		 430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  36.81 
 
 		 409 aa  253  5.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 418 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 416 aa  249  8e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  38.65 
 
 		 404 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  38.8 
 
 		 417 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  40.37 
 
 		 422 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  38.48 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  40.84 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  40.21 
 
 		 423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  38.29 
 
 		 398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  39.84 
 
 		 720 aa  243  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  40.67 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  40.67 
 
 		 398 aa  242  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  40.54 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  40.91 
 
 		 418 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  42.55 
 
 		 486 aa  240  4e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  39.02 
 
 		 425 aa  239  6.999999999999999e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  37.93 
 
 		 398 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  34.58 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  38.2 
 
 		 398 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  36.61 
 
 		 434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  36.25 
 
 		 413 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  39.2 
 
 		 398 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.53 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  36.22 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  37.98 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.07 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  36.53 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  35.88 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  39.19 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  38.84 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  35.85 
 
 		 407 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  36.53 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  36.39 
 
 		 407 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  36.15 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  38.54 
 
 		 407 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  37.92 
 
 		 464 aa  223  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  35.89 
 
 		 396 aa  223  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  38.53 
 
 		 400 aa  222  9e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  38.07 
 
 		 398 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  36.84 
 
 		 491 aa  220  3e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  36.02 
 
 		 405 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  34.99 
 
 		 464 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  35.94 
 
 		 438 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  35.83 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  33.41 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  35.7 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  33.73 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  37.54 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.93 
 
 		 421 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  38.89 
 
 		 392 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 451 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  33.49 
 
 		 424 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4006  putative membrane-bound lytic transglycosylase precursor protein, putative signal peptide  37.67 
 
 		 406 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.883363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  37.54 
 
 		 393 aa  216  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  36.84 
 
 		 474 aa  216  7e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1316  putative peptidoglycan-binding protein  36.09 
 
 		 427 aa  216  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  35.68 
 
 		 411 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.04 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  35.42 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  36.89 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>