148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4113 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 300 aa  629  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  70.83 
 
 		 293 aa  465  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.51 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.12 
 
 		 273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.44 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.12 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.39 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.67 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.18 
 
 		 253 aa  93.2  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  28 
 
 		 268 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.99 
 
 		 261 aa  87  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  24.9 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.36 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.15 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.07 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.07 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.48 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  26.79 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.39 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  26.22 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.3 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.59 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.74 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.92 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.78 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.78 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.19 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.33 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.72 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.11 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.57 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.39 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.39 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2672  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.86 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.39 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.47 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2489  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.89 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  22.99 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.81 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.07 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.3 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.84 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1945  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.8 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.597579 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  28.25 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  28.64 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.67 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.9 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.9 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.8 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.95 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  24.26 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.51 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  28.76 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29381  predicted protein  29.86 
 
 		 329 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  28.57 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.95 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0564  BarB2  25.38 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.09 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.56 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.58 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0897  BarB2  25 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43511  predicted protein  30.18 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.288196 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2596  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  25 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2460  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  25 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.61 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.85 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  27.69 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.92 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.82 
 
 		 230 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  28.57 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  27.69 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  27.69 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  27.69 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  27.69 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.85 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.88 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.48 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  32.23 
 
 		 289 aa  53.9  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12551  hypothetical protein  27.52 
 
 		 241 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.26 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  26.92 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.44 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  25.58 
 
 		 276 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  25.97 
 
 		 276 aa  52.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.66 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.05 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5986  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.9 
 
 		 344 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.45 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0003  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.12 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0103837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  26.4 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.5 
 
 		 253 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.88 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.76 
 
 		 279 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32238  predicted protein  27 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.194456 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0578  hypothetical protein  30.89 
 
 		 310 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>