169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3562 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 480 aa  970    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  44.67 
 
 		 478 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  40.17 
 
 		 483 aa  320  5e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  35.83 
 
 		 498 aa  292  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  36.95 
 
 		 501 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  35.06 
 
 		 651 aa  278  1e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  33.92 
 
 		 456 aa  250  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  30.13 
 
 		 527 aa  238  3e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  33.84 
 
 		 486 aa  219  7.999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  29.15 
 
 		 495 aa  213  7e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  32.84 
 
 		 481 aa  206  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  29.91 
 
 		 442 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  27.02 
 
 		 442 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  28.14 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  27.97 
 
 		 441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  26.97 
 
 		 443 aa  169  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.61 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  26.25 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  23.41 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.99 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.84 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.81 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  29.81 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  21.98 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  22.04 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  23.92 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  20.33 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  30.25 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  23.74 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  23.02 
 
 		 418 aa  67  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  26.32 
 
 		 380 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.06 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  27.09 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  30.93 
 
 		 792 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  23.91 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  24.37 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  26.99 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.57 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  26.99 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  21.52 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  22.92 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  21.52 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  25.46 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  21.08 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  22.84 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  24.89 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  28.23 
 
 		 1061 aa  60.1  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.73 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  27.75 
 
 		 1061 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  27.37 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0837  hypothetical protein  22.03 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00840057  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  25.91 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  30.36 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  21.38 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  21.74 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  23.79 
 
 		 378 aa  57  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.29 
 
 		 364 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  25.26 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0055  permease YjgP/YjgQ family protein  19.91 
 
 		 449 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.853634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  19.49 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  24.55 
 
 		 357 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  24.03 
 
 		 359 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  21.95 
 
 		 423 aa  55.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  24.5 
 
 		 392 aa  55.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  20.42 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  25.26 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.93 
 
 		 359 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  26.72 
 
 		 355 aa  54.3  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  23.69 
 
 		 414 aa  53.9  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  25.13 
 
 		 384 aa  53.5  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  27.83 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  22.09 
 
 		 364 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  27.16 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  20.42 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2200  YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.395164  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  20.42 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 1040 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  25 
 
 		 371 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  26.04 
 
 		 388 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  22.56 
 
 		 396 aa  52.8  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  24.29 
 
 		 389 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  26.29 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  18.39 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  29.2 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  24.56 
 
 		 388 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  21.74 
 
 		 387 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  28.03 
 
 		 364 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  20.22 
 
 		 1153 aa  51.2  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  26.92 
 
 		 360 aa  50.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 371 aa  50.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  21.4 
 
 		 366 aa  50.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  24.56 
 
 		 371 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  24.22 
 
 		 395 aa  50.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  27.16 
 
 		 358 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  19.57 
 
 		 392 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>