More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3128 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3128  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  80.32 
 
 		 249 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0386  ABC transporter related  63.16 
 
 		 248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3037  ABC transporter-related protein  60.17 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  57.45 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  59.82 
 
 		 241 aa  278  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  59.82 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  56.83 
 
 		 229 aa  276  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  55.74 
 
 		 242 aa  275  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  58.74 
 
 		 253 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  56.72 
 
 		 253 aa  274  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  58.3 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  55.74 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  51.44 
 
 		 260 aa  270  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  53.74 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  60.66 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  55.61 
 
 		 226 aa  266  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  53.95 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  57.21 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  52.02 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  53.53 
 
 		 241 aa  261  6e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  53.81 
 
 		 242 aa  261  6e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 		 228 aa  261  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  57.78 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  53.98 
 
 		 225 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  58.56 
 
 		 233 aa  258  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  55.31 
 
 		 244 aa  257  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  52.52 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  55.86 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  55.8 
 
 		 227 aa  253  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  56.25 
 
 		 233 aa  252  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  53.15 
 
 		 233 aa  252  5.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  53.78 
 
 		 235 aa  251  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  53.15 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  52.36 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  55.07 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  55.07 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  55.16 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  55.07 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  54.05 
 
 		 244 aa  249  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  51.32 
 
 		 230 aa  248  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  52.97 
 
 		 224 aa  248  7e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  51.11 
 
 		 252 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  53.36 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  54.05 
 
 		 237 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  51.11 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  54.95 
 
 		 653 aa  246  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  51.82 
 
 		 251 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  52.89 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  51.8 
 
 		 224 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  53.3 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  49.58 
 
 		 237 aa  246  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  50.66 
 
 		 227 aa  245  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  51.8 
 
 		 224 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  52.25 
 
 		 224 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  52.25 
 
 		 224 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  51.8 
 
 		 224 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  52.25 
 
 		 224 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  54.71 
 
 		 277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  52.25 
 
 		 224 aa  244  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  50.45 
 
 		 226 aa  244  9e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0222  ABC transporter related  54.59 
 
 		 247 aa  244  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256244  hitchhiker  0.00918813 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 226 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  51.35 
 
 		 226 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 226 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 226 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  54.95 
 
 		 234 aa  243  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  51.8 
 
 		 224 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  51.35 
 
 		 226 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  52.65 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 226 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 226 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  51.35 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  51.27 
 
 		 707 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4296  ABC transporter related  55.95 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0438871  normal  0.557698 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  59.51 
 
 		 211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  52.25 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  53.54 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  50.45 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  51.35 
 
 		 226 aa  242  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  52.84 
 
 		 232 aa  242  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  51.79 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  54.3 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  54.3 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  52.68 
 
 		 239 aa  241  6e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  50.66 
 
 		 236 aa  241  6e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1837  ABC transporter related  52.51 
 
 		 228 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000603885  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  52.23 
 
 		 238 aa  241  7.999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  50.45 
 
 		 224 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  53.07 
 
 		 238 aa  240  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  53.33 
 
 		 255 aa  239  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  53.6 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  52.25 
 
 		 657 aa  238  5e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  53.15 
 
 		 657 aa  238  6.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  51.1 
 
 		 266 aa  238  9e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  47.88 
 
 		 238 aa  238  9e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  54.42 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>