211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3929 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  43 
 
 		 986 aa  741    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  43.51 
 
 		 995 aa  740    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1011 aa  2025    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  41.3 
 
 		 1053 aa  582  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.88 
 
 		 1029 aa  406  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  36.64 
 
 		 1550 aa  342  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  36.82 
 
 		 1119 aa  314  5.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  33.82 
 
 		 983 aa  307  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  31.63 
 
 		 1055 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.67 
 
 		 919 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  33.19 
 
 		 1038 aa  302  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  32.26 
 
 		 1028 aa  303  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  33.81 
 
 		 1001 aa  299  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  37.4 
 
 		 3506 aa  299  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.81 
 
 		 1848 aa  298  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  37.36 
 
 		 1782 aa  292  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.74 
 
 		 972 aa  291  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  31.97 
 
 		 1033 aa  288  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  32.62 
 
 		 995 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  31.13 
 
 		 1004 aa  286  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  33.24 
 
 		 1001 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  32.19 
 
 		 991 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.41 
 
 		 1125 aa  281  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.53 
 
 		 1227 aa  281  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  33.81 
 
 		 990 aa  280  7e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0131  lipoprotein  39.76 
 
 		 657 aa  279  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.2 
 
 		 1285 aa  278  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  36.49 
 
 		 1508 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6306  beta strand repeat-containing protein  38.32 
 
 		 653 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662487 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6465  beta strand repeat-containing protein  38.52 
 
 		 653 aa  273  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.696651  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6700  beta strand repeat-containing protein  38.52 
 
 		 653 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162952 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1881 aa  272  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  38.16 
 
 		 683 aa  271  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.17 
 
 		 634 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  35.33 
 
 		 2003 aa  270  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6047  beta strand repeat-containing protein  38.92 
 
 		 652 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.649226 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  39 
 
 		 652 aa  268  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  35.08 
 
 		 641 aa  265  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  38.77 
 
 		 661 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  30.84 
 
 		 1519 aa  257  8e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  30.92 
 
 		 650 aa  255  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.24 
 
 		 634 aa  253  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  35.14 
 
 		 2365 aa  248  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  35.14 
 
 		 2346 aa  247  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  36.12 
 
 		 2396 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  33.6 
 
 		 2371 aa  233  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  33.44 
 
 		 2366 aa  231  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  32.61 
 
 		 1130 aa  231  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  32.72 
 
 		 1129 aa  230  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  32.72 
 
 		 1131 aa  230  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  32.72 
 
 		 1131 aa  230  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  32.72 
 
 		 1131 aa  230  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  32.56 
 
 		 1131 aa  228  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  32.56 
 
 		 1129 aa  228  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  32.51 
 
 		 1333 aa  227  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  31.66 
 
 		 677 aa  226  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  31.02 
 
 		 1006 aa  220  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  32.56 
 
 		 1131 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  35.41 
 
 		 1177 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  31.21 
 
 		 3954 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  33.23 
 
 		 4238 aa  214  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  33.23 
 
 		 3822 aa  214  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  33.09 
 
 		 4238 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  35.26 
 
 		 1056 aa  202  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  32.53 
 
 		 994 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  30.74 
 
 		 1164 aa  201  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  32.06 
 
 		 1062 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  30.88 
 
 		 985 aa  198  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  32.48 
 
 		 2711 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  40.31 
 
 		 348 aa  171  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  30.03 
 
 		 1016 aa  163  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  29.53 
 
 		 1152 aa  155  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  31.91 
 
 		 1011 aa  151  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.19 
 
 		 1081 aa  148  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  40.73 
 
 		 816 aa  148  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  28.31 
 
 		 980 aa  142  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.1 
 
 		 465 aa  132  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.58 
 
 		 425 aa  132  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  29.14 
 
 		 1180 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.85 
 
 		 1532 aa  128  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.57 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 		 926 aa  121  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.78 
 
 		 910 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.74 
 
 		 431 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  28.06 
 
 		 1019 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  26.07 
 
 		 814 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.47 
 
 		 3629 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  32.67 
 
 		 423 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  28.01 
 
 		 882 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3908  putative phosphatase  32.67 
 
 		 423 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  30.3 
 
 		 1769 aa  111  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3788  putative phosphatase  31.2 
 
 		 423 aa  110  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.95 
 
 		 915 aa  108  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  28.69 
 
 		 407 aa  106  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  25.99 
 
 		 1066 aa  100  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.26 
 
 		 1489 aa  99.4  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  27.31 
 
 		 488 aa  94.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  27.76 
 
 		 1459 aa  94  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  38.95 
 
 		 987 aa  92  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  26.37 
 
 		 1078 aa  90.9  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>