More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4025 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  54.89 
 
 		 607 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  54.89 
 
 		 607 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  56.74 
 
 		 601 aa  685    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  57.43 
 
 		 598 aa  687    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  52.37 
 
 		 615 aa  637    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238787  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  55.81 
 
 		 605 aa  679    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 		 615 aa  635    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  53.4 
 
 		 606 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0227  elongation factor Tu family protein  62.52 
 
 		 609 aa  793    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  58.06 
 
 		 606 aa  702    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 		 614 aa  641    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  53.15 
 
 		 605 aa  636    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  54.7 
 
 		 602 aa  670    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  54.46 
 
 		 602 aa  671    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0875  GTP-binding protein TypA  65.07 
 
 		 608 aa  811    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  52.9 
 
 		 603 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  54.47 
 
 		 607 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 		 614 aa  641    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  51.24 
 
 		 614 aa  641    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2008  GTP-binding protein TypA  53.8 
 
 		 607 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.511019 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  51.4 
 
 		 614 aa  642    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  58.71 
 
 		 608 aa  712    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  53.9 
 
 		 608 aa  650    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  53.9 
 
 		 608 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  65.07 
 
 		 608 aa  811    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  54.13 
 
 		 602 aa  670    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  56.98 
 
 		 613 aa  689    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2746  GTP-binding protein TypA  53.14 
 
 		 607 aa  639    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.163334  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  58.37 
 
 		 606 aa  699    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  60.36 
 
 		 614 aa  754    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  56.74 
 
 		 610 aa  706    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  62.77 
 
 		 614 aa  798    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  58.54 
 
 		 608 aa  711    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  58.71 
 
 		 608 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  55.79 
 
 		 609 aa  678    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  54.21 
 
 		 606 aa  646    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  84.6 
 
 		 606 aa  1050    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  56.29 
 
 		 602 aa  695    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  58.37 
 
 		 608 aa  706    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  63.65 
 
 		 608 aa  807    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 		 607 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  58.71 
 
 		 608 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  64.26 
 
 		 608 aa  794    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  56.26 
 
 		 598 aa  680    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  64.36 
 
 		 608 aa  802    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  54.55 
 
 		 607 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  51.24 
 
 		 614 aa  641    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  65.18 
 
 		 608 aa  810    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  53.59 
 
 		 614 aa  668    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  51.4 
 
 		 614 aa  639    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  56.48 
 
 		 603 aa  689    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  53.73 
 
 		 604 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0148  GTP-binding protein TypA  67.93 
 
 		 613 aa  808    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.592571  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2101  GTP-binding protein TypA  84.6 
 
 		 606 aa  1050    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  58.54 
 
 		 608 aa  711    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2558  GTP-binding protein TypA  54.38 
 
 		 609 aa  651    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551008  hitchhiker  0.00829209 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0103  GTP-binding protein TypA  61.94 
 
 		 607 aa  759    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  60.62 
 
 		 614 aa  752    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0673  GTP-binding protein TypA  52.92 
 
 		 596 aa  642    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  59.7 
 
 		 614 aa  748    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1650  GTP-binding protein TypA  81.46 
 
 		 606 aa  1025    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.741768  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  62.77 
 
 		 607 aa  763    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2526  GTP-binding protein TypA  62.44 
 
 		 607 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  56.74 
 
 		 602 aa  684    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2429  GTP-binding protein TypA  53.87 
 
 		 607 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.456233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  57.81 
 
 		 608 aa  701    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  53.31 
 
 		 603 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0699  GTP-binding protein TypA  62.6 
 
 		 607 aa  767    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  58.71 
 
 		 608 aa  712    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0644  GTP-binding protein TypA  63.2 
 
 		 627 aa  793    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770181  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0373  GTP-binding protein TypA  52.37 
 
 		 615 aa  639    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554499  normal  0.0314222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  58.54 
 
 		 607 aa  695    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  52.16 
 
 		 603 aa  638    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  53.4 
 
 		 603 aa  636    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  81.95 
 
 		 606 aa  1027    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  63.77 
 
 		 610 aa  777    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  58.04 
 
 		 608 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  54.21 
 
 		 623 aa  666    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  65.78 
 
 		 607 aa  806    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  55.7 
 
 		 602 aa  668    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  56.09 
 
 		 599 aa  672    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  55.15 
 
 		 609 aa  655    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  58.54 
 
 		 608 aa  711    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  64.24 
 
 		 610 aa  787    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  53.4 
 
 		 603 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  53.4 
 
 		 603 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  55.98 
 
 		 602 aa  663    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  52.9 
 
 		 603 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  53.22 
 
 		 608 aa  641    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  58.71 
 
 		 608 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  52.56 
 
 		 605 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  55.41 
 
 		 610 aa  673    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3483  GTP-binding virulence regulator protein BipA  53.65 
 
 		 607 aa  638    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.325344 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2369  GTP-binding protein TypA  83.61 
 
 		 606 aa  1039    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.543086 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 606 aa  1228    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  58.71 
 
 		 608 aa  712    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  58.04 
 
 		 608 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3380  GTP-binding protein TypA  53.55 
 
 		 608 aa  644    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465428  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  53.65 
 
 		 611 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  53.07 
 
 		 603 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>