More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0956 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_4615  non-specific serine/threonine protein kinase  43.86 
 
 
1082 aa  817    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916541  hitchhiker  0.0000304153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0282  SNF2 family helicase  42.54 
 
 
1080 aa  787    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0956  SNF2-related  100 
 
 
1075 aa  2214    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0419207  unclonable  0.0000716871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1010  SNF2-related protein  39.11 
 
 
1248 aa  727    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4264  SNF2-related protein  39.67 
 
 
1259 aa  726    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4585  SNF2-related protein  36.2 
 
 
1291 aa  627  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6039  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.5 
 
 
1010 aa  326  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1068  hypothetical protein  32.82 
 
 
1128 aa  307  7e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  34.6 
 
 
1131 aa  302  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1359  hypothetical protein  37.28 
 
 
1146 aa  300  9e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003242  helicase putative  36.86 
 
 
1149 aa  298  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919418  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  36.08 
 
 
918 aa  283  9e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  36.99 
 
 
918 aa  281  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  36.59 
 
 
918 aa  278  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  36.2 
 
 
918 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  36.2 
 
 
918 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  36.2 
 
 
918 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  35.62 
 
 
918 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  36.2 
 
 
918 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  36.2 
 
 
918 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  36.01 
 
 
918 aa  274  6e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  36.01 
 
 
918 aa  273  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3788  SNF2-related protein  35.2 
 
 
1148 aa  270  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  35.24 
 
 
1072 aa  269  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  36.24 
 
 
1019 aa  268  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  35.25 
 
 
1185 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  36.25 
 
 
892 aa  258  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  35.73 
 
 
1175 aa  257  1.0000000000000001e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  35.17 
 
 
777 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  35.31 
 
 
917 aa  255  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  34.69 
 
 
902 aa  254  9.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  35.29 
 
 
901 aa  251  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 
898 aa  251  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  33.14 
 
 
1019 aa  250  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
1152 aa  249  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.6 
 
 
1112 aa  248  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  33.71 
 
 
1055 aa  248  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  34 
 
 
924 aa  248  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 
1047 aa  247  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  33.66 
 
 
1065 aa  247  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  34.48 
 
 
1047 aa  247  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.07 
 
 
925 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.58 
 
 
1067 aa  245  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.52 
 
 
1048 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 
1028 aa  245  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 
1074 aa  242  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  33.53 
 
 
1021 aa  242  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  32.23 
 
 
1063 aa  242  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.88 
 
 
1029 aa  241  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 
1050 aa  241  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  34.58 
 
 
1099 aa  241  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  34.14 
 
 
886 aa  242  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  33.88 
 
 
621 aa  241  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.36 
 
 
933 aa  241  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  33.65 
 
 
1078 aa  241  8e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  33.4 
 
 
1033 aa  239  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  34.81 
 
 
899 aa  238  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  36.79 
 
 
1073 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 
1073 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  32.5 
 
 
773 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.86 
 
 
1007 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  32.67 
 
 
663 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 
617 aa  235  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  32.24 
 
 
876 aa  235  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3307  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.17 
 
 
1033 aa  235  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.834499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  32.14 
 
 
980 aa  235  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  32.49 
 
 
1006 aa  234  5e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  33.53 
 
 
903 aa  234  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  32.88 
 
 
1048 aa  234  6e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  34.66 
 
 
1082 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  34.86 
 
 
1082 aa  233  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  34.66 
 
 
1082 aa  233  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.18 
 
 
1073 aa  232  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  35.07 
 
 
1086 aa  231  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  31.92 
 
 
958 aa  231  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  34.54 
 
 
1091 aa  231  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  36.38 
 
 
1073 aa  231  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  36.2 
 
 
1080 aa  230  9e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  34.2 
 
 
1068 aa  230  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  32.33 
 
 
988 aa  230  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  32.27 
 
 
931 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  34.47 
 
 
1100 aa  229  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  34.98 
 
 
1437 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  31.72 
 
 
1161 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 
1104 aa  228  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  32.78 
 
 
1194 aa  226  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  31.81 
 
 
1007 aa  226  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  33.81 
 
 
1108 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.09 
 
 
1026 aa  226  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  34.52 
 
 
1073 aa  225  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  34.76 
 
 
1070 aa  224  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  33.33 
 
 
1013 aa  224  7e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  34.62 
 
 
914 aa  224  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  30.81 
 
 
1113 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 
1113 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  31.19 
 
 
990 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  32.66 
 
 
1040 aa  222  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  34.14 
 
 
1250 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  33.93 
 
 
1088 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  34.42 
 
 
918 aa  221  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>