64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1709 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  100 
 
 		 896 aa  1796    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  37.02 
 
 		 911 aa  519  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  36.25 
 
 		 913 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  33.74 
 
 		 930 aa  424  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  34.18 
 
 		 916 aa  402  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  30.66 
 
 		 872 aa  390  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  30.5 
 
 		 862 aa  386  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  32.76 
 
 		 912 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  32.93 
 
 		 940 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.63 
 
 		 906 aa  303  7.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  27.35 
 
 		 858 aa  294  6e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  26.91 
 
 		 858 aa  289  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  30.23 
 
 		 922 aa  280  8e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.75 
 
 		 935 aa  253  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  26.07 
 
 		 908 aa  114  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  19.58 
 
 		 803 aa  67.4  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  25.44 
 
 		 864 aa  67  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  21.81 
 
 		 909 aa  66.6  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  24.46 
 
 		 919 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  28.08 
 
 		 991 aa  62.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  28.16 
 
 		 846 aa  62.4  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  26.33 
 
 		 976 aa  61.6  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  27.9 
 
 		 994 aa  58.5  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.67 
 
 		 1048 aa  57.4  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  22.64 
 
 		 951 aa  57  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  24.55 
 
 		 984 aa  57  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  32.77 
 
 		 1016 aa  56.6  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.58 
 
 		 1048 aa  54.7  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.62 
 
 		 958 aa  54.7  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  33.15 
 
 		 1000 aa  54.3  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  22.32 
 
 		 781 aa  53.1  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25 
 
 		 836 aa  52  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  28.65 
 
 		 990 aa  52  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1042 aa  52  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.42 
 
 		 1019 aa  51.6  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  31.45 
 
 		 1037 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  26.6 
 
 		 1052 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  32.02 
 
 		 997 aa  49.3  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  29.61 
 
 		 980 aa  49.3  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.26 
 
 		 957 aa  48.9  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  20.37 
 
 		 969 aa  49.3  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  32.02 
 
 		 997 aa  48.9  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  20.37 
 
 		 969 aa  49.3  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.24 
 
 		 1049 aa  48.5  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  25.24 
 
 		 991 aa  48.5  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  24.92 
 
 		 993 aa  47.8  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  24.28 
 
 		 856 aa  48.1  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.17 
 
 		 957 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  20.25 
 
 		 968 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  26.09 
 
 		 855 aa  47.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 		 1016 aa  46.6  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  29.75 
 
 		 1045 aa  47  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  25.3 
 
 		 1049 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  30.38 
 
 		 1047 aa  47  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1049 aa  45.8  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1049 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  32.05 
 
 		 1054 aa  45.8  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  29.41 
 
 		 986 aa  45.8  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  32.28 
 
 		 1040 aa  45.8  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  23.98 
 
 		 988 aa  45.8  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1039 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  23.45 
 
 		 865 aa  44.7  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  25.94 
 
 		 997 aa  44.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  24.63 
 
 		 962 aa  44.3  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>