262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0471 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0471  permease  100 
 
 		 357 aa  706    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0518  permease  63.16 
 
 		 356 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0132  permease  65.07 
 
 		 363 aa  427  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0757  permease  60.89 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0353  permease  52.19 
 
 		 352 aa  344  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0132  permease, putative  48.91 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1469  permease  48.82 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.604132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1966  hypothetical protein  41.01 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1997  permease  42.33 
 
 		 365 aa  249  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0298  permease  36.52 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0446  permease  34.56 
 
 		 433 aa  239  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302988 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03565  permease  37.06 
 
 		 391 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1797  permease  34.08 
 
 		 406 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000323943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0526  permease  37.89 
 
 		 350 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0014  permease  59.06 
 
 		 451 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2651  permease  40.31 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371621 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1382  permease  34.35 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4074  putative permease  35.28 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6834  permease  36.18 
 
 		 620 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0434  permease  46.67 
 
 		 461 aa  156  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0397  hypothetical protein  50.69 
 
 		 490 aa  146  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0580  hypothetical protein  44.44 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3410  permease  43.43 
 
 		 474 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3911  permease  49.03 
 
 		 513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3409  permease  46.2 
 
 		 509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3838  permease  49.03 
 
 		 511 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.446121 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4034  permease  48.39 
 
 		 500 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0422  permease  48.77 
 
 		 503 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0444  hypothetical protein  47.17 
 
 		 491 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3399  permease  46.75 
 
 		 495 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0447  permease  47.56 
 
 		 496 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3582  permease  44.97 
 
 		 501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0495  permease  48.68 
 
 		 510 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0443  permease  35.2 
 
 		 497 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2549  permease  27.48 
 
 		 368 aa  123  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3941  permease  28.71 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.371691 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  28.22 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  26.16 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3634  permease  27.57 
 
 		 714 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0944  transporter  25 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_877  permease  25.81 
 
 		 343 aa  87.4  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  26.46 
 
 		 306 aa  87.4  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  27.68 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  25.85 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  24.7 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  25.19 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0584  permease, putative  23.21 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0907  permease  25.47 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000511133  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1748  permease  25.89 
 
 		 362 aa  80.9  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000179413  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0828  permease  25.72 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000427926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  25.18 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  25.9 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  23.81 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  25.48 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1802  permease  25.24 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0700  permease  24.85 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  25.24 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0503  hypothetical protein  23.58 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  23.78 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0044  permease family protein  21.22 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0147  putative permease  22.46 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0045  putative permease  21.22 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.151776  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1107  permease  25.71 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3199  permease  24.83 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4808  permease  23.05 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  23.08 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  27.16 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0721  permease  23.1 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3932  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  25.45 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  24.22 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  23.88 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1006  permease, putative  25.4 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0459509  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  24.49 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  24.71 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0158  permease  22.9 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3989  putative permease  24.76 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.531766  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  24.9 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  24.49 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  25.44 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  23.55 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3797  putative permease  23.67 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236031 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  24.47 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  24.7 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  25.16 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  22.89 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  25 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  24.47 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  24.35 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0434  hypothetical protein  23.68 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.313959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3596  hypothetical protein  23.7 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  22.54 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  22.54 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  25.16 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  25.16 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  23.94 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  22.49 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  22.84 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1837  hypothetical protein  21.75 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.249688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  23.86 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  25.09 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>