More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3084 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 819 aa  1658    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  60.63 
 
 		 728 aa  838    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  60.6 
 
 		 728 aa  833    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  48.78 
 
 		 737 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  64.29 
 
 		 809 aa  1048    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  49.93 
 
 		 726 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  52.45 
 
 		 729 aa  742    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  50.5 
 
 		 772 aa  675    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  95.4 
 
 		 805 aa  1543    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  50.5 
 
 		 772 aa  675    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  47.34 
 
 		 761 aa  610  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  43.58 
 
 		 802 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  45.55 
 
 		 734 aa  581  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  41.83 
 
 		 800 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  43.02 
 
 		 763 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  43.02 
 
 		 768 aa  575  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  40.95 
 
 		 801 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  40.46 
 
 		 801 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  42.75 
 
 		 720 aa  568  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  43.53 
 
 		 759 aa  545  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  41 
 
 		 808 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  39.13 
 
 		 804 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  38.89 
 
 		 804 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  39.97 
 
 		 728 aa  522  1e-146  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  41.23 
 
 		 724 aa  512  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  41.95 
 
 		 753 aa  506  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  39.49 
 
 		 823 aa  498  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  37.47 
 
 		 755 aa  481  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  39.68 
 
 		 737 aa  478  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  41.46 
 
 		 754 aa  475  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  40.42 
 
 		 729 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  40.53 
 
 		 768 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  40.23 
 
 		 746 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  38.9 
 
 		 744 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  39.38 
 
 		 730 aa  465  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  37.83 
 
 		 804 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  38.72 
 
 		 756 aa  459  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  39.03 
 
 		 771 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  39.13 
 
 		 764 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  39.94 
 
 		 777 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  40.38 
 
 		 722 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  39.36 
 
 		 762 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  38.45 
 
 		 753 aa  442  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  40.41 
 
 		 749 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  37.41 
 
 		 725 aa  437  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  38.28 
 
 		 761 aa  439  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  37.64 
 
 		 709 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  38.89 
 
 		 758 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  38.71 
 
 		 722 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  37.3 
 
 		 712 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  37.83 
 
 		 764 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  37.32 
 
 		 773 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  34.91 
 
 		 804 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  36.93 
 
 		 746 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  36.55 
 
 		 729 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  36.05 
 
 		 770 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  34.57 
 
 		 851 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  35.89 
 
 		 700 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  36.55 
 
 		 731 aa  389  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  35.01 
 
 		 879 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  34.57 
 
 		 839 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  36.2 
 
 		 773 aa  386  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  35.03 
 
 		 742 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  32.95 
 
 		 730 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  28.59 
 
 		 811 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.48 
 
 		 811 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  30.45 
 
 		 705 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 		 698 aa  230  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 728 aa  228  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 719 aa  224  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 706 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  29.99 
 
 		 743 aa  219  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 702 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  29.03 
 
 		 702 aa  217  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 751 aa  217  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 742 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  30.61 
 
 		 707 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 743 aa  211  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 707 aa  211  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 707 aa  210  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 743 aa  210  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 743 aa  210  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 743 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 		 738 aa  208  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 727 aa  208  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  29.84 
 
 		 743 aa  207  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  28.28 
 
 		 729 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 712 aa  201  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 710 aa  200  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 742 aa  200  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 726 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 		 708 aa  199  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  27.67 
 
 		 710 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 727 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 710 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 718 aa  197  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 730 aa  196  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 716 aa  191  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  27.59 
 
 		 727 aa  191  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.98 
 
 		 704 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>