More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0520 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  100 
 
 		 377 aa  770    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  88.53 
 
 		 377 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  88.3 
 
 		 377 aa  684    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  75.47 
 
 		 377 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  51.6 
 
 		 376 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  51.33 
 
 		 376 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07601  NAD binding site  47.06 
 
 		 375 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  49.19 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  46.76 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1650  geranylgeranyl reductase  46.49 
 
 		 381 aa  342  9e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  36.76 
 
 		 376 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  35.23 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  34.05 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  34.76 
 
 		 370 aa  241  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  33.42 
 
 		 376 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  33.24 
 
 		 374 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  34.57 
 
 		 368 aa  232  9e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  27.34 
 
 		 378 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  25.45 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  25.93 
 
 		 379 aa  99.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  24.71 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.28 
 
 		 382 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  25.52 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  23.41 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  23.79 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  23.14 
 
 		 368 aa  85.9  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  22.67 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  22.88 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.86 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  23.63 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  25.34 
 
 		 393 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  24.39 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.41 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  22.51 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  23 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  24.06 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  23.18 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  24.11 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  25.32 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.51 
 
 		 379 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  26.25 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  22.86 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  22.53 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  23.12 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  22.61 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.14 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  27 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  21.72 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  23.77 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  22.42 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  22.2 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  25.89 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  23.75 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.37 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  22.93 
 
 		 410 aa  67  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  25.89 
 
 		 428 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  23.46 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  21.35 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  29.49 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  24.75 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  24.09 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.23 
 
 		 396 aa  66.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  25.89 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  25.38 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  23.9 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  24.69 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.16 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  24.18 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  20.35 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  21.85 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  25.38 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  23.61 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  23.1 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0269  geranylgeranyl reductase  22.22 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0349456 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  21.47 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  23.5 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  24.68 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  22.75 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  23.95 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  23.95 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1496  hypothetical protein  21.43 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403861 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3556  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0049  putative oxidoreductase FixC  24.68 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  22.55 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4412  geranylgeranyl reductase  21.84 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0475548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3311  tryptophan halogenase  22.66 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.23 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1916  hypothetical protein  21.68 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>