254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63653 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  100 
 
 
868 aa  1786    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  46.7 
 
 
923 aa  342  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  24.84 
 
 
482 aa  84.3  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10516  SCF E3 ubiquitin ligase complex F-box protein grrA (SCF substrate adapter protein grrA)(F-box and leucine-rich repeat protein grrA)(F-box/LRR-repeat protein grrA) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q15I80]  24.92 
 
 
585 aa  83.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000155754  normal  0.727522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  31.54 
 
 
454 aa  81.3  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  22.44 
 
 
482 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.79 
 
 
858 aa  67.8  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83849  protein required for glucose repression and for glucose and cation transport  23.32 
 
 
725 aa  64.3  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03480  ubiquitin-protein ligase, putative  26.75 
 
 
928 aa  63.9  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.918815  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04987  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit (PKA regulatory subunit) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O59922]  31.3 
 
 
412 aa  63.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.599779  normal  0.51731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  27.56 
 
 
563 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  39.36 
 
 
407 aa  63.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5210  cyclic nucleotide-binding protein  29.93 
 
 
355 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.465426  normal  0.688608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6450  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.29 
 
 
253 aa  62.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3842  cyclic nucleotide-binding protein  29.1 
 
 
582 aa  62.4  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306863  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  27.47 
 
 
419 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  31.48 
 
 
628 aa  62  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0343  cyclic nucleotide-binding protein  21.31 
 
 
811 aa  61.2  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0783507  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  28.93 
 
 
275 aa  60.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3549  cyclic nucleotide-binding protein  28.36 
 
 
582 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.864417 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  29.85 
 
 
413 aa  60.1  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.13 
 
 
224 aa  60.1  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0590  cyclic nucleotide-binding protein  20.76 
 
 
801 aa  59.3  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120802  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.43 
 
 
503 aa  58.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.7 
 
 
408 aa  58.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  25.82 
 
 
412 aa  58.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  31.13 
 
 
486 aa  57.8  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4038  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.12 
 
 
409 aa  57.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  26.71 
 
 
626 aa  57.8  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04535  F-box domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02860)  20.24 
 
 
723 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.131568 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.61 
 
 
223 aa  57.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1570  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.17 
 
 
424 aa  57  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3891  cyclic nucleotide-binding protein  33.57 
 
 
155 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
225 aa  57  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4140  cyclic nucleotide-binding protein  29.75 
 
 
243 aa  57  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.03 
 
 
408 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.05 
 
 
146 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.43 
 
 
216 aa  57  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0161  cyclic nucleotide-binding protein  27.97 
 
 
161 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.13 
 
 
225 aa  57  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.57 
 
 
141 aa  57  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  25.56 
 
 
238 aa  56.6  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2440  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.37 
 
 
509 aa  55.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00769093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  28.36 
 
 
308 aa  56.2  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  26.85 
 
 
419 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0596  catabolite gene activator Crp  37.74 
 
 
214 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
232 aa  55.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4663  cyclic nucleotide-binding protein  32.73 
 
 
332 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  29.27 
 
 
626 aa  55.8  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
238 aa  55.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 
495 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  33.03 
 
 
217 aa  55.1  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  28.95 
 
 
157 aa  54.7  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  26.83 
 
 
1048 aa  54.7  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  29.13 
 
 
225 aa  54.7  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.7 
 
 
425 aa  54.7  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  28.7 
 
 
425 aa  54.7  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2303  MscS Mechanosensitive ion channel  33.75 
 
 
512 aa  54.3  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.697138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  37.25 
 
 
388 aa  54.3  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  25.56 
 
 
215 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.91 
 
 
242 aa  54.3  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4284  cyclic nucleotide-binding protein  31.82 
 
 
332 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.2 
 
 
219 aa  53.9  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  26.26 
 
 
171 aa  53.9  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4370  cyclic nucleotide-binding protein  31.82 
 
 
332 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.518531  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46419  predicted protein  30.17 
 
 
816 aa  54.3  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_5235  predicted protein  21.54 
 
 
263 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.82 
 
 
224 aa  53.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3304  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.73 
 
 
243 aa  53.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.13 
 
 
1075 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  26.35 
 
 
629 aa  53.5  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  28.15 
 
 
169 aa  53.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  25.56 
 
 
215 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.8 
 
 
171 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.68 
 
 
220 aa  52.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01888  hypothetical protein  33.33 
 
 
629 aa  52.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 
243 aa  52.4  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12211  predicted protein  32.61 
 
 
528 aa  52.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
224 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4577  cAMP-regulatory protein  34.91 
 
 
214 aa  52  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  26.52 
 
 
149 aa  52.4  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3674  cyclic nucleotide-binding protein  23.4 
 
 
788 aa  52.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.301148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4020  cyclic nucleotide-binding  42.86 
 
 
367 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109231  normal  0.727114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4779  cAMP-regulatory protein  31.91 
 
 
214 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.77 
 
 
226 aa  52.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  36.27 
 
 
388 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.04 
 
 
212 aa  52  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  29.06 
 
 
212 aa  52  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.32 
 
 
225 aa  52  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2085  cyclic nucleotide binding protein  28.19 
 
 
238 aa  51.6  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  29.1 
 
 
627 aa  51.6  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2797  cAMP-regulatory protein  36.99 
 
 
198 aa  51.6  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  22.29 
 
 
409 aa  51.6  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  22.81 
 
 
626 aa  51.6  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0067  cyclic nucleotide-binding protein  36.08 
 
 
153 aa  51.6  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.821564  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
236 aa  51.2  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0051  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 
629 aa  51.2  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  27.34 
 
 
322 aa  51.2  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  30.11 
 
 
449 aa  50.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.83 
 
 
228 aa  50.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>