65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0161 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0161  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 161 aa  330  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1878  cyclic nucleotide-binding protein  32.56 
 
 		 275 aa  57.8  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.116046  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  27.97 
 
 		 868 aa  56.6  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  32.54 
 
 		 449 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  35.71 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  28.04 
 
 		 367 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  38.95 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33 
 
 		 242 aa  51.2  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0722  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 		 243 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000366193  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0420  cyclic nucleotide-binding protein  34.34 
 
 		 255 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4569  putative cyclic nucleotide binding protein  35.23 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.51 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 		 419 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1298  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  28.7 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000825589  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 247 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 214 aa  48.5  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  30.34 
 
 		 482 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.03 
 
 		 231 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  37.68 
 
 		 388 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  27.52 
 
 		 407 aa  48.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04510  cyclic nucleotide-binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03170)  33.65 
 
 		 923 aa  47.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.08 
 
 		 225 aa  47.4  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.3 
 
 		 225 aa  47.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.3 
 
 		 225 aa  47.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  40.3 
 
 		 388 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 229 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.81 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 228 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1108  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 1075 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000733786  normal  0.267995 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.25 
 
 		 425 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 495 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  29.25 
 
 		 425 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1570  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 424 aa  45.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 		 435 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 597 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0165  cyclic nucleotide-binding  30.77 
 
 		 124 aa  44.7  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1926  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.7 
 
 		 168 aa  44.3  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.09 
 
 		 224 aa  44.3  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1513  cyclic nucleotide-binding protein  25.64 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00604424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2511  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  27.78 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2905  cyclic nucleotide-binding protein  25.89 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0600936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  32.04 
 
 		 563 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2504  cyclic nucleotide-binding protein  27.62 
 
 		 628 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  29.25 
 
 		 225 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11563  predicted protein  33.33 
 
 		 238 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.684972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 226 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 594 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2760  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 174 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.378531  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2556  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.03 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 228 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3692  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.12 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.36 
 
 		 225 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4944  cyclic nucleotide-binding protein  30.59 
 
 		 454 aa  41.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3203  cyclic nucleotide-binding protein  30.91 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.9 
 
 		 220 aa  41.2  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 228 aa  41.2  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 		 225 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2946  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 369 aa  40.8  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360561  normal  0.390891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  26.27 
 
 		 637 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.85 
 
 		 239 aa  40.8  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.95 
 
 		 223 aa  40.8  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.62 
 
 		 225 aa  40.8  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>