More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10567 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  100 
 
 
284 aa  584  1e-166  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  43.87 
 
 
352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.58 
 
 
315 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36252  predicted protein  38.36 
 
 
320 aa  179  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.140786  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  39.19 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
327 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
290 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
312 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
317 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.42 
 
 
326 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 
300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  37.26 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
320 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
315 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.07 
 
 
305 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
304 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.13 
 
 
326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  33.97 
 
 
329 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  35.67 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  37.67 
 
 
300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  36.16 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
320 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
305 aa  151  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
311 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
326 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  36.54 
 
 
303 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
319 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
322 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  35.92 
 
 
320 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
298 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  37.42 
 
 
320 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
304 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
307 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
307 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  32.89 
 
 
301 aa  149  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.81 
 
 
313 aa  148  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  37.75 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 
324 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  34.75 
 
 
319 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.46 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
312 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
341 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  37.46 
 
 
303 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 
343 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.82 
 
 
320 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 
288 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.12 
 
 
328 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
289 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
289 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
308 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
289 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
325 aa  143  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  38.91 
 
 
320 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
298 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
298 aa  142  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  34.78 
 
 
301 aa  141  9e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  33.56 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  34.92 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
341 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  38.49 
 
 
292 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
305 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
331 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  34.31 
 
 
321 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
313 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  37.62 
 
 
299 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
305 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 
308 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  35.31 
 
 
306 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  35.31 
 
 
306 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
326 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.67 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  35.02 
 
 
302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  35.31 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  35.47 
 
 
306 aa  136  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.42 
 
 
307 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.39 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  32.67 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
349 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216927  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  32.67 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
312 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
313 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
303 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>