More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_52311 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_52311  diatom response regulator 3  100 
 
 
414 aa  857    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44514  light histidine kinase  36.33 
 
 
850 aa  183  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10948  predicted protein  53.51 
 
 
120 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  36.84 
 
 
631 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  32.56 
 
 
968 aa  101  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
1054 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 
1791 aa  97.4  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
1305 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  31.84 
 
 
676 aa  97.1  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  24.51 
 
 
1055 aa  97.1  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.68 
 
 
835 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
973 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 
969 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  29.72 
 
 
671 aa  94.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
822 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  41.32 
 
 
1014 aa  92  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  28.74 
 
 
751 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
1005 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.5 
 
 
763 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.43 
 
 
1692 aa  92.8  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  28.64 
 
 
691 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 
974 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  33.47 
 
 
559 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 
644 aa  91.3  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 
947 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  37.78 
 
 
765 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.52 
 
 
620 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
877 aa  90.1  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.65 
 
 
1442 aa  90.1  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 
865 aa  89.7  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 
863 aa  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  41.53 
 
 
977 aa  89.7  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
721 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  39.26 
 
 
850 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  29.65 
 
 
606 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4576  histidine kinase  27.4 
 
 
678 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.354871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
899 aa  89.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.618287  normal  0.57938 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 
902 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  30.23 
 
 
982 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.77 
 
 
582 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 
993 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
817 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 
887 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
674 aa  87  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 
936 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 
1070 aa  86.7  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  29.57 
 
 
1028 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 
1820 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0522  response regulator receiver protein  39.29 
 
 
125 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.77 
 
 
991 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.69 
 
 
812 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  27.96 
 
 
497 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
667 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.9 
 
 
772 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.92 
 
 
784 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0387  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
1068 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  30.17 
 
 
758 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  31.42 
 
 
571 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0578  histidine kinase  30.77 
 
 
732 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3242  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 
1027 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.073449  normal  0.0177381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
1691 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
785 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 
662 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 
909 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.52 
 
 
965 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0537  response regulator receiver protein  37.5 
 
 
125 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
1199 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0588  ATP-binding region ATPase domain protein  31.03 
 
 
1068 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.5 
 
 
1000 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.27 
 
 
1331 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 
1240 aa  84  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  30.77 
 
 
742 aa  84  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.73 
 
 
1499 aa  84  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 
1040 aa  83.6  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.77 
 
 
1223 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  37.31 
 
 
590 aa  84  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 
835 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64230  RetS (regulator of exopolysaccharide and Type III secretion)  30.51 
 
 
942 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0403381  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 
913 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.72 
 
 
1127 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  33.99 
 
 
777 aa  83.2  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 
695 aa  83.2  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
899 aa  83.2  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.76 
 
 
1397 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
1075 aa  83.2  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5576  sensor/response regulator hybrid  30.51 
 
 
962 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4759  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 
593 aa  82.8  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  38.05 
 
 
1177 aa  82.8  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 
962 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  32.28 
 
 
847 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.97 
 
 
1550 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 
827 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 
818 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.03 
 
 
1039 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
1069 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0706  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 
928 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357941  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 
1384 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3693  histidine kinase  36.49 
 
 
667 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
995 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4614  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
923 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863482  normal  0.296425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>