More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3807 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
259 aa  520  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4156  pentapeptide repeat protein  51.16 
 
 
261 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4196  pentapeptide repeat protein  51.16 
 
 
261 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666213  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  47.88 
 
 
256 aa  223  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0369  pentapeptide repeat-containing protein  46.72 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  45.2 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1107  TPR repeat-containing protein  44.76 
 
 
266 aa  171  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.684682  normal  0.836 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27891  hypothetical protein  35.12 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  45.8 
 
 
145 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  41.98 
 
 
145 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  41.98 
 
 
145 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  40.41 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  39.69 
 
 
151 aa  90.9  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  48.48 
 
 
149 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  48.48 
 
 
149 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  44.8 
 
 
1033 aa  88.6  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 
168 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  42.34 
 
 
259 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  44.88 
 
 
175 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  43.65 
 
 
190 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  39.84 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  41.59 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  39.84 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  45.65 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  39.23 
 
 
156 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  53.68 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3786  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3735  pentapeptide repeat-containing protein  40.62 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  45.63 
 
 
900 aa  79.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  44.54 
 
 
449 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  54.65 
 
 
245 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  48.15 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4358  pentapeptide repeat protein  40.94 
 
 
152 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.748004 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  45.69 
 
 
142 aa  79  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  49.54 
 
 
184 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  39.46 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  55.06 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  44.66 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  43.88 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  56.47 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  48.45 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  38.64 
 
 
401 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  49.48 
 
 
745 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  38.64 
 
 
401 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  39.13 
 
 
386 aa  75.5  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  42.37 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  48.62 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0258  hypothetical protein  48.15 
 
 
147 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  53.06 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  35.46 
 
 
681 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  43.52 
 
 
567 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  48.11 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  49 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0250  hypothetical protein  37.69 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  55.7 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  40.8 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  47.13 
 
 
903 aa  72.8  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  35.61 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  43.75 
 
 
168 aa  72  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  44.35 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  38.32 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  37.59 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  48.89 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  46.9 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  43.56 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  46.84 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  51.52 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  41.18 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  46.84 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  44.27 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  40.29 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2376  pentapeptide repeat-containing protein  46.67 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0340424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  47.71 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  57.5 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  37.5 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1853  pentapeptide repeat protein  48.98 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150883  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  48.91 
 
 
517 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
576 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  51.11 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  54.76 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  51.58 
 
 
493 aa  69.3  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  42.98 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  35.54 
 
 
446 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  52.33 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  45.28 
 
 
489 aa  68.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1850  pentapeptide repeats domain protein  45.56 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  41.6 
 
 
143 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  43.9 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3175  pentapeptide repeat-containing protein  45.56 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3076  pentapeptide repeat-containing oxetanocin A resistance protein  45.56 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  43.62 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  46.3 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  41.9 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  47.56 
 
 
824 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3406  pentapeptide repeats domain protein  45.56 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3425  pentapeptide repeat-containing protein  45.56 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  42.86 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  49.44 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  52.38 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>