193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_00281 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  100 
 
 		 292 aa  597  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  92.1 
 
 		 292 aa  557  1e-158  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  84.25 
 
 		 292 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  76.29 
 
 		 293 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  47.59 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  50.86 
 
 		 302 aa  300  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  47.08 
 
 		 298 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  47.6 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  45.39 
 
 		 317 aa  281  6.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  45.7 
 
 		 307 aa  272  5.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  42.7 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.68 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.01 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.24 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  38.08 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.56 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  37.32 
 
 		 279 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.32 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.54 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.08 
 
 		 288 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.28 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  37.63 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1005  hypothetical protein  40 
 
 		 268 aa  181  2e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 		 282 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  35.09 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0474  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.64 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  34.74 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  34.71 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  34.35 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  34.35 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.57 
 
 		 291 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.08 
 
 		 285 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.8 
 
 		 291 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.16 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.05 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.88 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.28 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.4 
 
 		 290 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 		 260 aa  165  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  34.46 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0706  hypothetical protein  38.1 
 
 		 273 aa  154  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.56 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.841243  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0297  hypothetical protein  33.82 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  35.62 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  27.74 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.78 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.48 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  30.93 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.64 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.43 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  30.69 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 313 aa  99.4  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.96 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  29.6 
 
 		 280 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.36 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1765  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 		 358 aa  89.7  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 283 aa  89.4  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41088  predicted protein  27.88 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.309401  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 		 298 aa  85.9  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 		 302 aa  85.5  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.74 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 		 310 aa  85.5  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  26.92 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0070  hypothetical protein  26.57 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3050  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.51 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.861172  normal  0.107005 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  26.67 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0069  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.656046  normal  0.384268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5305  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.04 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.622115  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0667  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48420  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  25.44 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.727055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.71 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0296892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 		 345 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0790099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  23.64 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.59 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0547097  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1346  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.55 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5214  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.69 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.304626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2045  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.11 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70550  hypothetical protein  24.91 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.448663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0902  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.84 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>