296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0667 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0667  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 322 aa  624  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.79 
 
 		 313 aa  342  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1128  putative oxidoreductase protein  67.56 
 
 		 302 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799427  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.54 
 
 		 315 aa  330  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.343169  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.33 
 
 		 318 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60 
 
 		 318 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.53 
 
 		 307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.2 
 
 		 310 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.51 
 
 		 305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.71 
 
 		 313 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169967  normal  0.952388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.28 
 
 		 342 aa  288  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.63 
 
 		 332 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303852  hitchhiker  0.0000588283 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.68 
 
 		 302 aa  278  6e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.94 
 
 		 291 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51364  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2562  putative oxidoreductase protein  55.56 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3137  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.2 
 
 		 341 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1765  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.38 
 
 		 358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0793  hypothetical protein  50.77 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2433  putative oxidoreductase protein  52.54 
 
 		 341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.706626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.93 
 
 		 295 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1723  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.58 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0806  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.31 
 
 		 343 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.58 
 
 		 362 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.38 
 
 		 345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  53.85 
 
 		 296 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.288428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.38 
 
 		 345 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.68 
 
 		 345 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0790099 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.07 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.76 
 
 		 345 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.480362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.76 
 
 		 345 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0830  hypothetical protein  52.99 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.952788 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1965  hypothetical protein  50.61 
 
 		 362 aa  261  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0794806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2721  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.63 
 
 		 325 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0272  hypothetical protein  50.61 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0481971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0876  hypothetical protein  50.61 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000605644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0949  hypothetical protein  50.61 
 
 		 359 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  50.31 
 
 		 359 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1152  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  50.31 
 
 		 362 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0611519  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0992  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  50.31 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00471724  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2860  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.68 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2647  hypothetical protein  43.36 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0823  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  40.91 
 
 		 299 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158805 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.06 
 
 		 291 aa  225  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0540  hypothetical protein  46.15 
 
 		 313 aa  222  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.05 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.861168  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.01 
 
 		 292 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  41.34 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.92 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.151733  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 		 287 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.478902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0273  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.75 
 
 		 282 aa  113  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1818  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.85 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180368  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2793  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0222  hypothetical protein  34.59 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0212  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.52 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0507401  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5421  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625366  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1385  hypothetical protein  33.8 
 
 		 279 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3315  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.14 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.454656  normal  0.502777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2341  hypothetical protein  36.02 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0053  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.8 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3291  hypothetical protein  37.1 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3131  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.75 
 
 		 287 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1336  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1356  NAD dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  28.77 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2196  hypothetical protein  27.69 
 
 		 280 aa  99.8  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0402  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.41 
 
 		 287 aa  99.8  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2224  hypothetical protein  29.8 
 
 		 280 aa  99.4  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2932  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.487981  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 		 291 aa  97.1  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 		 327 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.16 
 
 		 291 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25 
 
 		 292 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0984  hypothetical protein  27.78 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.915194  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2661  hypothetical protein  36.36 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.221687 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2384  hypothetical protein  35.83 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0313191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4318  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 		 289 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1046  hypothetical protein  27.78 
 
 		 289 aa  89.7  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.18 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0955775  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3378  hypothetical protein  29.9 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.697299  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  24.58 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.232249  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1200  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0978  hypothetical protein  32.98 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479439  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00341  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.94 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.98 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.170441 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1782  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  33.1 
 
 		 280 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370358  normal  0.55049 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0029  hypothetical protein  24.42 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0036  hypothetical protein  33.2 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0339  hypothetical protein  30 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00301  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.27 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.979033  normal  0.104273 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0032  hypothetical protein  31.77 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00281  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.75 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.755474  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3533  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1936  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.24 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  0.040657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>