More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4328 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  100 
 
 		 482 aa  908    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  46.55 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  45.57 
 
 		 487 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.14 
 
 		 487 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43 
 
 		 527 aa  279  6e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.37 
 
 		 487 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.24 
 
 		 508 aa  274  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 483 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.71 
 
 		 498 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  39.25 
 
 		 470 aa  266  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 481 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 		 763 aa  259  6e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.66 
 
 		 490 aa  252  8.000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  37.45 
 
 		 491 aa  251  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.56 
 
 		 474 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.41 
 
 		 509 aa  244  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.55 
 
 		 500 aa  243  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.79 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.69 
 
 		 519 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 		 506 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.4 
 
 		 501 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.94 
 
 		 534 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.02 
 
 		 514 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.57 
 
 		 493 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.86 
 
 		 487 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.22 
 
 		 788 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.17 
 
 		 489 aa  233  8.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  38.39 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.15 
 
 		 553 aa  230  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 		 518 aa  229  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  36.86 
 
 		 497 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.03 
 
 		 496 aa  227  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.61 
 
 		 519 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.01 
 
 		 488 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.62 
 
 		 757 aa  225  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2068  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 496 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  39.29 
 
 		 454 aa  223  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.87 
 
 		 522 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.92 
 
 		 482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  40.65 
 
 		 492 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  42.09 
 
 		 501 aa  220  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.35 
 
 		 478 aa  219  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.83 
 
 		 505 aa  219  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.59 
 
 		 489 aa  216  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  38.43 
 
 		 483 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1835  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0636096  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  36.4 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1233  putative transmembrane efflux protein  42.72 
 
 		 505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2211  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214988  normal  0.704415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  36.88 
 
 		 498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3442  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.37 
 
 		 530 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.477749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.94 
 
 		 499 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.41 
 
 		 502 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 486 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1077  major facilitator superfamily permease  33.56 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.51 
 
 		 502 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  39.82 
 
 		 513 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 470 aa  206  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 494 aa  206  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4680  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 		 467 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 513 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.96 
 
 		 488 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000908237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.8 
 
 		 504 aa  203  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.12 
 
 		 543 aa  202  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.41 
 
 		 487 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  38.17 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  37.8 
 
 		 489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.29 
 
 		 479 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.1 
 
 		 487 aa  201  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.66 
 
 		 1112 aa  199  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.92 
 
 		 498 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 499 aa  199  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  33.2 
 
 		 733 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.02 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 507 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.49 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 478 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.36 
 
 		 520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2069  major facilitator superfamily permease  32.71 
 
 		 440 aa  196  7e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2306  major facilitator superfamily transporter  36.36 
 
 		 543 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864673  normal  0.0994822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.01 
 
 		 504 aa  196  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.3 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.3 
 
 		 482 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 519 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  31.75 
 
 		 467 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0892  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 508 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  39.85 
 
 		 463 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  36.52 
 
 		 493 aa  194  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 503 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.83 
 
 		 539 aa  193  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0633  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 474 aa  192  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0624  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 475 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.42 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1718  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.45 
 
 		 479 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>