276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1177 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  100 
 
 		 590 aa  1218    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  34.64 
 
 		 597 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.19 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  33.16 
 
 		 596 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.13 
 
 		 588 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34.24 
 
 		 591 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.79 
 
 		 588 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  34.62 
 
 		 612 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  34.56 
 
 		 592 aa  362  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  32.59 
 
 		 584 aa  337  3.9999999999999995e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  33.51 
 
 		 573 aa  333  6e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  32.47 
 
 		 589 aa  327  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  31.12 
 
 		 578 aa  325  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.22 
 
 		 573 aa  325  1e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.65 
 
 		 603 aa  323  5e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.33 
 
 		 607 aa  322  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  31.79 
 
 		 571 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  31.41 
 
 		 597 aa  302  9e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  32.46 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.25 
 
 		 601 aa  299  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.26 
 
 		 615 aa  297  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  34.15 
 
 		 573 aa  292  9e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  29.47 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  29.47 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  33.98 
 
 		 573 aa  291  3e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.09 
 
 		 617 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  34.21 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  31.78 
 
 		 566 aa  287  5e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.25 
 
 		 620 aa  286  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  30.6 
 
 		 569 aa  286  5.999999999999999e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  29.98 
 
 		 620 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.27 
 
 		 617 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.83 
 
 		 620 aa  281  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  29.82 
 
 		 620 aa  279  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.54 
 
 		 616 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  29.51 
 
 		 619 aa  276  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.82 
 
 		 627 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  29.13 
 
 		 615 aa  273  6e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.25 
 
 		 622 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.86 
 
 		 614 aa  270  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  28.43 
 
 		 626 aa  268  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  27.8 
 
 		 607 aa  266  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.5 
 
 		 616 aa  262  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  28.48 
 
 		 664 aa  260  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.3 
 
 		 634 aa  259  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  28.24 
 
 		 625 aa  258  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.38 
 
 		 625 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.21 
 
 		 625 aa  254  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.24 
 
 		 601 aa  252  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.56 
 
 		 616 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  27.2 
 
 		 606 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.75 
 
 		 620 aa  251  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  28.24 
 
 		 610 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.71 
 
 		 623 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  28.07 
 
 		 632 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  27.86 
 
 		 626 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.44 
 
 		 606 aa  241  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  26.78 
 
 		 606 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.78 
 
 		 606 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  27.12 
 
 		 611 aa  238  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.5 
 
 		 608 aa  237  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.95 
 
 		 638 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  29.78 
 
 		 597 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.81 
 
 		 586 aa  221  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  29.76 
 
 		 577 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.87 
 
 		 582 aa  206  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  28.29 
 
 		 601 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  26.69 
 
 		 594 aa  203  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2755  oligoendopeptidase F  29.22 
 
 		 606 aa  196  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000210431  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0253  oligoendopeptidase F  29.51 
 
 		 590 aa  196  9e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.41 
 
 		 598 aa  196  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.65 
 
 		 593 aa  193  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1169  oligoendopeptidase F  25.76 
 
 		 644 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.325773 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  26.72 
 
 		 599 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  26.36 
 
 		 608 aa  188  2e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.3 
 
 		 603 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  26.05 
 
 		 599 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  24.26 
 
 		 609 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.79 
 
 		 584 aa  184  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  26.01 
 
 		 587 aa  183  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4682  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  26.53 
 
 		 606 aa  183  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  22.71 
 
 		 603 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  24.21 
 
 		 600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  24.61 
 
 		 619 aa  181  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1018  oligoendopeptidase F  25.42 
 
 		 602 aa  181  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0179915  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0999  oligoendopeptidase F  25.42 
 
 		 602 aa  181  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1121  oligoendopeptidase F  25 
 
 		 600 aa  179  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3585  oligoendopeptidase F  24.17 
 
 		 605 aa  177  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1920  oligoendopeptidase F  25.83 
 
 		 600 aa  177  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3460  oligoendopeptidase F  26.88 
 
 		 601 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1205  oligoendopeptidase F  24.37 
 
 		 597 aa  175  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  25.54 
 
 		 595 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  26.56 
 
 		 593 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  27.1 
 
 		 597 aa  172  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0490  oligoendopeptidase F  24.51 
 
 		 603 aa  172  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  25.65 
 
 		 598 aa  170  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2686  oligoendopeptidase F  26.94 
 
 		 599 aa  170  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0580  oligoendopeptidase F  25.75 
 
 		 602 aa  170  9e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.970451  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  25.09 
 
 		 598 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2055  oligopeptidase F  25.25 
 
 		 646 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>