More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1493 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 243 aa  480  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.26 
 
 		 237 aa  391  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.83 
 
 		 237 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.83 
 
 		 237 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  51.71 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.7 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.56 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.58 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  48.9 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  49.15 
 
 		 228 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  48.72 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  48.72 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  46.54 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  44.29 
 
 		 233 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  43.98 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  46.79 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 241 aa  154  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  46.79 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  45.87 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  45.87 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  45.87 
 
 		 234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  44.4 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  46.33 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  43.8 
 
 		 234 aa  148  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  44.63 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  45.04 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  43.98 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  42.62 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  40.34 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  40.34 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  40.34 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  40.34 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  40.34 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  40.34 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  42.26 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  36.55 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.99 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  40.34 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  39.67 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  41.6 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  41.56 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  37.3 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09940  short-chain alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.920602  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  36.21 
 
 		 270 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 		 264 aa  99.4  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 235 aa  98.6  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 		 270 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.99 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  36.56 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  35.75 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.46 
 
 		 281 aa  96.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  35.12 
 
 		 304 aa  96.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 284 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 		 285 aa  95.9  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.300574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 271 aa  93.6  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3073  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.78 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.07 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.31 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  39.11 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.29 
 
 		 273 aa  92.4  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  31.35 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.09 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 		 251 aa  92  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.315729  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 		 249 aa  92  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 252 aa  92  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.06 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>