284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1514 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1514  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
284 aa  570  1.0000000000000001e-162  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1841  beta-lactamase domain protein  62.55 
 
 
284 aa  354  7.999999999999999e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.933589  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1029  beta-lactamase-like protein  49.64 
 
 
282 aa  265  5.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.605254  hitchhiker  0.000133815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0039  beta-lactamase-like protein  43.28 
 
 
287 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  37.11 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  35.66 
 
 
281 aa  171  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1394  beta-lactamase domain protein  33.83 
 
 
280 aa  169  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.238952  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1792  beta-lactamase domain protein  35.53 
 
 
285 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0970  putative metal-dependent hydrolase  34.78 
 
 
278 aa  166  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1275  beta-lactamase domain protein  34.33 
 
 
279 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4840  metallo-beta-lactamase family protein  33.45 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4832  metallo-beta-lactamase family protein  33.45 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.429672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4448  metal-dependent hydrolase  33.45 
 
 
284 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0426  metallo-beta-lactamase family protein  33.09 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4593  metallo-beta-lactamase family protein  33.45 
 
 
284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4430  metal-dependent hydrolase  33.45 
 
 
284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4949  metallo-beta-lactamase family protein  33.45 
 
 
284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4815  metallo-beta-lactamase family protein  33.45 
 
 
284 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1019  beta-lactamase domain protein  34.33 
 
 
284 aa  161  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.130366  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4810  metallo-beta-lactamase family protein  33.09 
 
 
284 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4529  beta-lactamase domain-containing protein  33.09 
 
 
302 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1138  putative metal-dependent hydrolase  32.13 
 
 
280 aa  159  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3849  beta-lactamase domain-containing protein  35.93 
 
 
281 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3361  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 
284 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3002  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 
280 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.605909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4741  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 
282 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815142  normal  0.153649 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 
280 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  29.69 
 
 
280 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0898  hypothetical protein  39.54 
 
 
288 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0423506  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  36.53 
 
 
284 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17550  metallo-beta-lactamase family protein  40.15 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09610  hypothetical protein  39.16 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4240  beta-lactamase domain protein  32.45 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1187  beta-lactamase domain-containing protein  29.75 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  35.42 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3821  beta-lactamase domain-containing protein  37.88 
 
 
288 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489041  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0336  beta-lactamase domain protein  36.78 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1518  hydrolase  29.41 
 
 
279 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  0.417814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  34.31 
 
 
283 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1554  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
295 aa  132  9e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal  0.925755 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03230  putative metal-dependent hydrolase  29.52 
 
 
287 aa  129  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2125  putative beta-lactamase  32.1 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592444  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1205  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.05 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8804  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1027  beta-lactamase domain protein  31.91 
 
 
297 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5423  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 
295 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4066  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.724377  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  27.88 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4788  beta-lactamase domain protein  35.25 
 
 
294 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.83 
 
 
287 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3353  beta-lactamase domain protein  31.51 
 
 
332 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  30.67 
 
 
282 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  27.27 
 
 
282 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3643  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 
299 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1891  beta-lactamase  28.47 
 
 
304 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0320252  normal  0.505786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4444  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 
302 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.398437  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
294 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4217  beta-lactamase-like protein  28.7 
 
 
302 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4283  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 
302 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0731  beta-lactamase-like  27.21 
 
 
283 aa  99  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.894293  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4368  Beta-lactamase-like  28.67 
 
 
315 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  29.37 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2457  beta-lactamase-like  29.71 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 
320 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  29.93 
 
 
322 aa  92.4  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0290  beta-lactamase domain protein  28.26 
 
 
317 aa  92  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7341  Beta-lactamase-like  27.24 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.931286  normal  0.839183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  30.24 
 
 
339 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7585  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 
266 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3119  Beta-lactamase-like  29.39 
 
 
297 aa  89.7  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  28.47 
 
 
327 aa  89  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  26.64 
 
 
329 aa  89  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8301  beta-lactamase domain protein  33.15 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.32 
 
 
293 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  29.03 
 
 
328 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  25.95 
 
 
321 aa  85.9  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0408  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  34.29 
 
 
263 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1292  beta-lactamase-like protein  27.17 
 
 
271 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  27.08 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 
327 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3214  beta-lactamase  28.2 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5633  beta-lactamase domain-containing protein  29.18 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4837  beta-lactamase domain-containing protein  28.02 
 
 
288 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  26.79 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  28.15 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  25.43 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  27.66 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  29.25 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  25.87 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  24.73 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  24.78 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  25.18 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  27.34 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  27.89 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  27.18 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  25.35 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  31.36 
 
 
249 aa  79  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>