More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1041 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  100 
 
 
547 aa  1091    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  47.25 
 
 
553 aa  467  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  41.94 
 
 
561 aa  451  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.73 
 
 
787 aa  419  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  42.23 
 
 
555 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.83 
 
 
553 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.39 
 
 
570 aa  412  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  42.88 
 
 
553 aa  415  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  39.78 
 
 
558 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  38.2 
 
 
562 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  38.03 
 
 
573 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  37.75 
 
 
564 aa  398  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.16 
 
 
558 aa  395  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  37.55 
 
 
563 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  38.96 
 
 
561 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  39.89 
 
 
553 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  38.95 
 
 
561 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  38.3 
 
 
571 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  41.08 
 
 
554 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.96 
 
 
571 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.48 
 
 
568 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  37.37 
 
 
568 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  36.72 
 
 
806 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  40.43 
 
 
561 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  41.36 
 
 
589 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  41.33 
 
 
569 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  37.01 
 
 
566 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  38.2 
 
 
557 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.01 
 
 
568 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  39.25 
 
 
746 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  38.7 
 
 
558 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  37.35 
 
 
571 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.41 
 
 
568 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  38.04 
 
 
564 aa  372  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.59 
 
 
568 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  38.39 
 
 
559 aa  369  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  37.18 
 
 
871 aa  371  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  40.76 
 
 
578 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  38.86 
 
 
557 aa  365  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.77 
 
 
568 aa  365  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.77 
 
 
568 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  38.57 
 
 
603 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  37.5 
 
 
582 aa  363  5.0000000000000005e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.3 
 
 
563 aa  363  5.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  39.21 
 
 
572 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  37.57 
 
 
577 aa  363  5.0000000000000005e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  40.43 
 
 
585 aa  362  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.81 
 
 
568 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.81 
 
 
568 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  38.3 
 
 
594 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  38.3 
 
 
599 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  40.04 
 
 
575 aa  357  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  37.46 
 
 
568 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  38.3 
 
 
599 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.59 
 
 
556 aa  355  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  40.83 
 
 
578 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  37.09 
 
 
565 aa  355  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  34.91 
 
 
568 aa  355  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  38.2 
 
 
565 aa  355  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  36.36 
 
 
570 aa  354  2.9999999999999997e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  38.99 
 
 
637 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  37.77 
 
 
599 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  35.88 
 
 
569 aa  352  8e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  38.91 
 
 
578 aa  352  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.16 
 
 
568 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  38.27 
 
 
563 aa  351  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  36.06 
 
 
576 aa  351  2e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  38.65 
 
 
574 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  37.32 
 
 
554 aa  350  5e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  36.88 
 
 
567 aa  350  6e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  36.3 
 
 
566 aa  349  6e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  41.77 
 
 
520 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  38.74 
 
 
595 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  35.76 
 
 
823 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  38.5 
 
 
545 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  38.88 
 
 
596 aa  347  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  38.54 
 
 
595 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  37.52 
 
 
586 aa  347  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  40.18 
 
 
571 aa  346  8e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  36.57 
 
 
605 aa  345  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  33.81 
 
 
561 aa  345  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  32.49 
 
 
561 aa  345  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  37.04 
 
 
567 aa  345  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  35.17 
 
 
563 aa  345  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  40.72 
 
 
520 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  36.38 
 
 
586 aa  343  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  36.74 
 
 
587 aa  343  4e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  39.27 
 
 
611 aa  343  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  38.39 
 
 
595 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  36.02 
 
 
585 aa  342  7e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  36.79 
 
 
577 aa  342  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  38.84 
 
 
688 aa  342  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  37.16 
 
 
546 aa  341  2e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  40.91 
 
 
521 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  36.1 
 
 
570 aa  341  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  40.23 
 
 
611 aa  340  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  34.84 
 
 
560 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  40.78 
 
 
611 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  40.78 
 
 
611 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  37.39 
 
 
586 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>