More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5571 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 253 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  88.54 
 
 		 253 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  72.47 
 
 		 253 aa  351  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  68.25 
 
 		 254 aa  334  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  68.25 
 
 		 254 aa  333  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  68.25 
 
 		 254 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  68.67 
 
 		 250 aa  330  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  66.26 
 
 		 256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  67.59 
 
 		 250 aa  321  8e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  66.8 
 
 		 250 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  68 
 
 		 258 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  67.87 
 
 		 257 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  66.67 
 
 		 261 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  67.2 
 
 		 257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  64.34 
 
 		 251 aa  301  8.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  60.57 
 
 		 254 aa  295  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  60.57 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  60.57 
 
 		 254 aa  295  4e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  60.98 
 
 		 256 aa  294  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  61.94 
 
 		 256 aa  292  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  59.76 
 
 		 256 aa  289  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  61.22 
 
 		 254 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  62.45 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  62.35 
 
 		 245 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  56.5 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  61.13 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  62.75 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  61.13 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  61.18 
 
 		 252 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  61.2 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  60.16 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  56.91 
 
 		 263 aa  254  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  57.94 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  63.22 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  55.13 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  54.47 
 
 		 262 aa  229  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  53.85 
 
 		 250 aa  218  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  57.6 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 249 aa  211  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  53.85 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  47.81 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  49.21 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 		 271 aa  205  7e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  48.59 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  48.43 
 
 		 263 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  44.9 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  51.85 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  45.97 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  46.09 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  46.34 
 
 		 251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  45.38 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  52.67 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 250 aa  198  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  52.67 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  46.67 
 
 		 263 aa  198  6e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  44.9 
 
 		 252 aa  198  6e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  44.98 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0154  Triose-phosphate isomerase  45.71 
 
 		 247 aa  198  7e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  49.19 
 
 		 249 aa  198  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  43.32 
 
 		 249 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  46.56 
 
 		 250 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 251 aa  197  9e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 245 aa  197  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  45.93 
 
 		 250 aa  198  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 251 aa  197  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  45.68 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2833  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.091999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  48.18 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  47.52 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  47.52 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62830  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5468  triosephosphate isomerase  50.82 
 
 		 251 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.50496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  43.78 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0717  triosephosphate isomerase  45.9 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  46.69 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  46.8 
 
 		 256 aa  194  8.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  47.15 
 
 		 248 aa  194  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  47.15 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  47.11 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3612  triosephosphate isomerase  49.59 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2019  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>