More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1737 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 351 aa  714    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  40.64 
 
 		 333 aa  229  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  36.81 
 
 		 328 aa  206  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  35.94 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.42 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  35.94 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  34.97 
 
 		 327 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  36.67 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  34.1 
 
 		 327 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  34.1 
 
 		 327 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  34.57 
 
 		 325 aa  192  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  36.73 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  34.01 
 
 		 324 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  35.19 
 
 		 337 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  35.57 
 
 		 362 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  35.48 
 
 		 328 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  35.28 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  35.28 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  36.99 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  33.43 
 
 		 328 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  33.43 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  33.43 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  33.43 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  33.43 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  33.43 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  34.77 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  33.43 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  33.82 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  35.14 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  36.3 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  32.88 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  34.29 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  33.23 
 
 		 350 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  31.92 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.16 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  31.65 
 
 		 360 aa  170  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  32.25 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  31.79 
 
 		 368 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  31.08 
 
 		 362 aa  169  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  32.35 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  31.78 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  31.78 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  32.08 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  31.81 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.43 
 
 		 346 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  31.34 
 
 		 378 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  30.88 
 
 		 351 aa  166  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  32.68 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  29.52 
 
 		 336 aa  159  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 347 aa  149  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  30.28 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  28.61 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  39.01 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  28.49 
 
 		 364 aa  143  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  29.21 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  29.5 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  29.62 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  30.9 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  37.35 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.71 
 
 		 344 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  29.15 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  29.31 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  33.89 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.5 
 
 		 323 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  36.42 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  37.88 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.08 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.71 
 
 		 344 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  42.37 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  36.69 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  35 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.99 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  37.13 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  41.29 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  33.92 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  32.48 
 
 		 190 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  35 
 
 		 324 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.33 
 
 		 386 aa  109  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  35.5 
 
 		 298 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  50.51 
 
 		 322 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0962  putative GTP-binding protein YjiA  36.79 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.177818  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.99 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  35.94 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  33.89 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  35.02 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  30.47 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.96 
 
 		 348 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  36.65 
 
 		 384 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  35.45 
 
 		 350 aa  106  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  32.78 
 
 		 310 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  34.13 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  32.22 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  31.36 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  34.13 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  39.89 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  31.74 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  35.62 
 
 		 362 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  38.01 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>