More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2148 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  100 
 
 
344 aa  684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  90.41 
 
 
344 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  81.1 
 
 
344 aa  552  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  80.23 
 
 
344 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  79.94 
 
 
344 aa  522  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  80.81 
 
 
344 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  68.73 
 
 
345 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  62.57 
 
 
348 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  63.24 
 
 
349 aa  408  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.77 
 
 
349 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  57.77 
 
 
343 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  63.37 
 
 
344 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  58.05 
 
 
344 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.77 
 
 
349 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.19 
 
 
349 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  55.32 
 
 
344 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.9 
 
 
349 aa  362  7.0000000000000005e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  51.9 
 
 
349 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  60 
 
 
350 aa  358  8e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.05 
 
 
354 aa  348  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  55.32 
 
 
350 aa  347  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.04 
 
 
357 aa  346  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.87 
 
 
334 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  50.43 
 
 
386 aa  334  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  57.06 
 
 
350 aa  330  2e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.3 
 
 
350 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.2 
 
 
363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  53.61 
 
 
348 aa  325  6e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  51.5 
 
 
367 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  51.14 
 
 
375 aa  322  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.29 
 
 
348 aa  322  5e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.62 
 
 
355 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.14 
 
 
358 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.73 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.17 
 
 
358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  51.22 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.31 
 
 
345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.62 
 
 
355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  50.29 
 
 
357 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.29 
 
 
357 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.29 
 
 
357 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.29 
 
 
357 aa  318  7e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  50.59 
 
 
335 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.58 
 
 
349 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.44 
 
 
355 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.29 
 
 
357 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.29 
 
 
390 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.29 
 
 
357 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  52.28 
 
 
346 aa  316  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  53.92 
 
 
345 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.92 
 
 
345 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  50.59 
 
 
354 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  50.3 
 
 
354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.78 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  50 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  51.03 
 
 
362 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.16 
 
 
359 aa  309  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  49.72 
 
 
362 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.72 
 
 
362 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.89 
 
 
362 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  49.85 
 
 
357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.29 
 
 
369 aa  305  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.99 
 
 
344 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.71 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.7 
 
 
343 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.33 
 
 
349 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  50 
 
 
343 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.09 
 
 
348 aa  292  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.46 
 
 
360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  38.73 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  40.62 
 
 
351 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  35.29 
 
 
354 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  35 
 
 
354 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  34.71 
 
 
354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  39.78 
 
 
369 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  38.97 
 
 
364 aa  231  9e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  41.64 
 
 
371 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  38.33 
 
 
381 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08051  putative cobalamin synthesis protein  32.93 
 
 
350 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  35.77 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.23 
 
 
323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  33.33 
 
 
319 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.03 
 
 
316 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.03 
 
 
316 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.43 
 
 
316 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.91 
 
 
323 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.91 
 
 
323 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.74 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.43 
 
 
316 aa  166  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  33.43 
 
 
316 aa  165  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.43 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.13 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  32.06 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  33.03 
 
 
316 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  32.32 
 
 
323 aa  163  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  33.23 
 
 
320 aa  162  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  32.62 
 
 
323 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  32.97 
 
 
360 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  32.34 
 
 
336 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>