More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_08051 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_08051  putative cobalamin synthesis protein  100 
 
 		 350 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  74.29 
 
 		 354 aa  544  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  74.29 
 
 		 354 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  74 
 
 		 354 aa  543  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  41.21 
 
 		 371 aa  322  7e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  46.11 
 
 		 344 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  41.74 
 
 		 369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  37.88 
 
 		 381 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  43.02 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  44.64 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.19 
 
 		 349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  38.86 
 
 		 348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.99 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.51 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  36.89 
 
 		 344 aa  230  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.69 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.24 
 
 		 348 aa  225  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  33.43 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.26 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.14 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  35 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  35.09 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  34.6 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.87 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.22 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.52 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  36.31 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.74 
 
 		 358 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.11 
 
 		 344 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.14 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.04 
 
 		 344 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.06 
 
 		 357 aa  209  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  35.33 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.8 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.64 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.37 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.43 
 
 		 369 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.07 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.78 
 
 		 362 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.14 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  34.47 
 
 		 362 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  34.47 
 
 		 362 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.47 
 
 		 362 aa  205  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  33.72 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.41 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.67 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.67 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  35.31 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.67 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.67 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  34.41 
 
 		 354 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.67 
 
 		 390 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.67 
 
 		 357 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  34.34 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  32.83 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.56 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.14 
 
 		 350 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.24 
 
 		 348 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.85 
 
 		 362 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.85 
 
 		 362 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  35.58 
 
 		 345 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.58 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.15 
 
 		 349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.11 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  36.08 
 
 		 335 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.83 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.01 
 
 		 355 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.28 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  33.63 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.75 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.32 
 
 		 355 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  33.23 
 
 		 357 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.74 
 
 		 344 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.64 
 
 		 344 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.57 
 
 		 349 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  30 
 
 		 344 aa  189  8e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.36 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  30 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.27 
 
 		 348 aa  186  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  32.4 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  30.56 
 
 		 326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  30.06 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0193  cobalamin synthesis protein P47K  28.9 
 
 		 320 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.9456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  33.6 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  29.77 
 
 		 343 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73010  hypothetical protein  24.86 
 
 		 400 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00487394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  34.71 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  27.43 
 
 		 406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  31.07 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  32.4 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  29.04 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  29.04 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  29.28 
 
 		 415 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  32.8 
 
 		 367 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  25.52 
 
 		 406 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  26.71 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  33.07 
 
 		 360 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  27.38 
 
 		 401 aa  125  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  33.75 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  40.7 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>