More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_09841 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  100 
 
 
344 aa  689    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  60.74 
 
 
351 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  58.26 
 
 
364 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  57.26 
 
 
369 aa  411  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  53.52 
 
 
381 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  53.54 
 
 
371 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  43.93 
 
 
354 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  43.35 
 
 
354 aa  318  9e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  43.93 
 
 
354 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08051  putative cobalamin synthesis protein  46.11 
 
 
350 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  46.97 
 
 
348 aa  289  4e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  44.95 
 
 
348 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.6 
 
 
343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.55 
 
 
349 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.4 
 
 
344 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  40.06 
 
 
344 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  43.28 
 
 
349 aa  263  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  41.86 
 
 
344 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.87 
 
 
349 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  46.22 
 
 
346 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.37 
 
 
343 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  42.36 
 
 
345 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  42.17 
 
 
358 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.55 
 
 
349 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.64 
 
 
349 aa  256  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  38.64 
 
 
349 aa  256  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.6 
 
 
354 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.74 
 
 
349 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  42.86 
 
 
375 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  40.75 
 
 
343 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.47 
 
 
355 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.76 
 
 
355 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  42.86 
 
 
350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.76 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.47 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.01 
 
 
386 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  41.54 
 
 
334 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  41.69 
 
 
335 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  40.52 
 
 
335 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  41.39 
 
 
348 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.82 
 
 
354 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  41.82 
 
 
354 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  40.65 
 
 
367 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  43.17 
 
 
345 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  40.06 
 
 
363 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  43.83 
 
 
345 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  43.83 
 
 
345 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.53 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  41.51 
 
 
357 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  43.27 
 
 
349 aa  233  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  39.24 
 
 
350 aa  232  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  39.19 
 
 
350 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  41.61 
 
 
350 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.46 
 
 
357 aa  230  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.64 
 
 
344 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.31 
 
 
348 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.3 
 
 
369 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.13 
 
 
357 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.13 
 
 
357 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.13 
 
 
357 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.13 
 
 
357 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.73 
 
 
344 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.13 
 
 
390 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.13 
 
 
357 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.66 
 
 
344 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.66 
 
 
344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.82 
 
 
357 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  38.3 
 
 
362 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.88 
 
 
362 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  38.48 
 
 
362 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.48 
 
 
362 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  41.44 
 
 
344 aa  219  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.43 
 
 
369 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.84 
 
 
359 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  39.02 
 
 
349 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.72 
 
 
362 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.72 
 
 
362 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  38.37 
 
 
344 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.35 
 
 
360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.81 
 
 
319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  30.88 
 
 
316 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.88 
 
 
316 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.88 
 
 
316 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  30.53 
 
 
319 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  31.97 
 
 
394 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.88 
 
 
316 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.96 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.96 
 
 
316 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  30.53 
 
 
319 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.59 
 
 
316 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  30.03 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  30.08 
 
 
375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  30.43 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  35.2 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  34.26 
 
 
367 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  33.86 
 
 
360 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  30.59 
 
 
316 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  31.49 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.09 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.09 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>