More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0671 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  100 
 
 		 350 aa  688    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  60.36 
 
 		 348 aa  404  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  57.02 
 
 		 349 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  58.7 
 
 		 345 aa  394  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  58.82 
 
 		 344 aa  393  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  55.07 
 
 		 349 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  57.31 
 
 		 349 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  55.36 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  62.31 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  57.02 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  60 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  59.41 
 
 		 344 aa  381  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  56.57 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  58.7 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  60.77 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  56.64 
 
 		 343 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  58.7 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  55.92 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  55.18 
 
 		 344 aa  352  5e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.65 
 
 		 357 aa  349  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  56.03 
 
 		 359 aa  346  4e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  56.64 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  56.76 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  57.06 
 
 		 345 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  53.35 
 
 		 348 aa  332  9e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  56.76 
 
 		 350 aa  331  1e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  56.76 
 
 		 345 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  55.03 
 
 		 350 aa  328  7e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  49.71 
 
 		 386 aa  325  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.83 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.87 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.87 
 
 		 357 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.58 
 
 		 357 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  50.58 
 
 		 357 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.58 
 
 		 357 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.58 
 
 		 357 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  51.83 
 
 		 335 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.58 
 
 		 390 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.2 
 
 		 334 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  51.93 
 
 		 335 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.44 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.85 
 
 		 349 aa  307  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  50.44 
 
 		 375 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.69 
 
 		 363 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.15 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.8 
 
 		 344 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  47.04 
 
 		 367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  49.71 
 
 		 346 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.1 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.79 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.71 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  48.27 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.55 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.43 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  48.35 
 
 		 354 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.58 
 
 		 355 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.26 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.01 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  47.77 
 
 		 362 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  47.43 
 
 		 362 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.43 
 
 		 362 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.86 
 
 		 358 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  47.31 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.86 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.91 
 
 		 369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.86 
 
 		 362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.74 
 
 		 369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.72 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  44.19 
 
 		 360 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  39.24 
 
 		 344 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  40.27 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  41.08 
 
 		 371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  40.57 
 
 		 369 aa  250  3e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  35.89 
 
 		 351 aa  232  9e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  33.53 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  33.24 
 
 		 354 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  35.29 
 
 		 364 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  32.94 
 
 		 354 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08051  putative cobalamin synthesis protein  33.63 
 
 		 350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  34.6 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  32.46 
 
 		 323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  32.46 
 
 		 323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  32.17 
 
 		 404 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  33.72 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  32.23 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  32.36 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  34.9 
 
 		 320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  32.17 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  31.82 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  31.02 
 
 		 316 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  33.93 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.02 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  33.24 
 
 		 343 aa  159  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  31.83 
 
 		 360 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.72 
 
 		 316 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.42 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.42 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  36.55 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.42 
 
 		 319 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.42 
 
 		 316 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>