More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0786 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  96.61 
 
 
354 aa  685    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  100 
 
 
354 aa  706    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  98.02 
 
 
354 aa  695    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08051  putative cobalamin synthesis protein  74.4 
 
 
350 aa  498  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  39.66 
 
 
371 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  43.93 
 
 
344 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  38.27 
 
 
369 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  43.9 
 
 
351 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  43.31 
 
 
364 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  36.94 
 
 
381 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.29 
 
 
349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  37.13 
 
 
348 aa  233  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.41 
 
 
349 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.34 
 
 
354 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.05 
 
 
349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  36.36 
 
 
345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.72 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.47 
 
 
344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.4 
 
 
349 aa  217  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.49 
 
 
357 aa  216  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  33.33 
 
 
349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.91 
 
 
350 aa  215  9e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  35.14 
 
 
344 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.71 
 
 
344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.14 
 
 
386 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.73 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.05 
 
 
349 aa  212  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.42 
 
 
344 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.66 
 
 
344 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  33.33 
 
 
343 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.2 
 
 
348 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.09 
 
 
343 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  33.33 
 
 
375 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.09 
 
 
344 aa  209  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.48 
 
 
344 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.09 
 
 
343 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.24 
 
 
363 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.04 
 
 
344 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  33.92 
 
 
367 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.93 
 
 
334 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  35.01 
 
 
346 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.75 
 
 
358 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.63 
 
 
349 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.74 
 
 
357 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.74 
 
 
390 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.74 
 
 
357 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.74 
 
 
357 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.74 
 
 
357 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.74 
 
 
357 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.74 
 
 
357 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.04 
 
 
344 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.42 
 
 
354 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.17 
 
 
362 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.63 
 
 
345 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.17 
 
 
362 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.7 
 
 
369 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  34.52 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  32.84 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  31.88 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.17 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.88 
 
 
362 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.35 
 
 
359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.92 
 
 
355 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  34.83 
 
 
350 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  31.88 
 
 
362 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.04 
 
 
344 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  32.56 
 
 
335 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.83 
 
 
369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.02 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.43 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  32.65 
 
 
350 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.04 
 
 
360 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.55 
 
 
358 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.13 
 
 
348 aa  195  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  33.53 
 
 
345 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.08 
 
 
345 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  31.96 
 
 
357 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.26 
 
 
349 aa  186  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  31.31 
 
 
350 aa  181  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  28.94 
 
 
323 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.28 
 
 
323 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.28 
 
 
323 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  27.89 
 
 
326 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  28.99 
 
 
323 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0193  cobalamin synthesis protein P47K  28.9 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.9456  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  32.67 
 
 
360 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  29.63 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  32.8 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  28.15 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  27.43 
 
 
323 aa  129  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  30.94 
 
 
347 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  24.33 
 
 
405 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  27.7 
 
 
324 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  28.86 
 
 
320 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  28.96 
 
 
404 aa  125  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  24.55 
 
 
406 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  30.4 
 
 
365 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  27.16 
 
 
324 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  24.92 
 
 
406 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 
364 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>