More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3662 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  100 
 
 
343 aa  699    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  95.03 
 
 
343 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  80.7 
 
 
344 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  71.18 
 
 
348 aa  487  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  65.6 
 
 
348 aa  448  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  66.47 
 
 
349 aa  446  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  68.91 
 
 
346 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  64.29 
 
 
358 aa  414  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  52.84 
 
 
386 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  53.2 
 
 
375 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.3 
 
 
355 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.87 
 
 
348 aa  351  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.09 
 
 
349 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.03 
 
 
363 aa  349  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.3 
 
 
355 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.68 
 
 
357 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  52.68 
 
 
357 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  54.33 
 
 
367 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.68 
 
 
357 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.68 
 
 
357 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.68 
 
 
390 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  52.16 
 
 
354 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.85 
 
 
358 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  52 
 
 
357 aa  345  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.38 
 
 
357 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.15 
 
 
355 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.19 
 
 
350 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.38 
 
 
357 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  53.41 
 
 
354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.64 
 
 
349 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.34 
 
 
349 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.7 
 
 
349 aa  332  6e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.76 
 
 
362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.7 
 
 
344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.47 
 
 
362 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  51.47 
 
 
362 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.2 
 
 
349 aa  323  3e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  49.39 
 
 
345 aa  322  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.7 
 
 
348 aa  322  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  48.2 
 
 
349 aa  322  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  50.88 
 
 
362 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.88 
 
 
362 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.18 
 
 
362 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.44 
 
 
369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.3 
 
 
344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.6 
 
 
354 aa  318  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.89 
 
 
349 aa  318  7e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.2 
 
 
344 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.75 
 
 
369 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  47.27 
 
 
344 aa  314  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  48.48 
 
 
335 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.29 
 
 
357 aa  312  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  46.65 
 
 
343 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.6 
 
 
344 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.55 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.9 
 
 
344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  51.21 
 
 
350 aa  305  7e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  49.7 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.03 
 
 
360 aa  302  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.61 
 
 
344 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.61 
 
 
344 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  46.91 
 
 
344 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.6 
 
 
349 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  45.78 
 
 
350 aa  296  3e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  48.4 
 
 
350 aa  295  6e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.4 
 
 
344 aa  294  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.4 
 
 
359 aa  291  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.4 
 
 
345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  44.94 
 
 
369 aa  280  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  49.11 
 
 
345 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.11 
 
 
345 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  43.29 
 
 
371 aa  270  2e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  44.55 
 
 
351 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  40.82 
 
 
381 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  41.62 
 
 
364 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  36.94 
 
 
354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  36.98 
 
 
354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  36.94 
 
 
354 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08051  putative cobalamin synthesis protein  35.74 
 
 
350 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  37.35 
 
 
323 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  39.29 
 
 
323 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  36.55 
 
 
323 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  37.09 
 
 
323 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  37.09 
 
 
323 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  36.47 
 
 
323 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  35.78 
 
 
335 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  35.47 
 
 
394 aa  188  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  33.82 
 
 
324 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  33.73 
 
 
404 aa  183  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  34.01 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  35.21 
 
 
337 aa  179  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  32.19 
 
 
363 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  33.61 
 
 
343 aa  176  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 
320 aa  175  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  35.57 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  35.57 
 
 
328 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  35.86 
 
 
329 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  30.34 
 
 
358 aa  172  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  35.04 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  32.1 
 
 
341 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>