More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1630 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  96.02 
 
 
362 aa  634    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  97.51 
 
 
362 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  98.62 
 
 
362 aa  726    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  96.31 
 
 
362 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  98.62 
 
 
362 aa  726    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  100 
 
 
362 aa  734    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  89.78 
 
 
369 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  82.6 
 
 
386 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  81.82 
 
 
357 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  81.82 
 
 
390 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  81.82 
 
 
357 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  81.82 
 
 
357 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  81.82 
 
 
357 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  81.53 
 
 
357 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  81.53 
 
 
357 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  80.49 
 
 
363 aa  564  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  80.77 
 
 
367 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  76.36 
 
 
369 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  62.85 
 
 
355 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  62.29 
 
 
355 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  62.92 
 
 
354 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  62.54 
 
 
350 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  61.73 
 
 
355 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  61.56 
 
 
357 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  66.01 
 
 
349 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  61.69 
 
 
375 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  62.05 
 
 
358 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  61.69 
 
 
349 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  63.27 
 
 
354 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.62 
 
 
349 aa  353  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.66 
 
 
360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  51.14 
 
 
348 aa  338  5.9999999999999996e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.74 
 
 
349 aa  338  8e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.91 
 
 
358 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.04 
 
 
349 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.8 
 
 
349 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.58 
 
 
344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.02 
 
 
348 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.44 
 
 
348 aa  328  9e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  49.44 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.16 
 
 
349 aa  324  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  50 
 
 
344 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.29 
 
 
354 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  50.42 
 
 
346 aa  322  7e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.71 
 
 
344 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.61 
 
 
343 aa  316  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.57 
 
 
343 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.44 
 
 
349 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.46 
 
 
344 aa  312  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.57 
 
 
344 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.29 
 
 
344 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  48.55 
 
 
345 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.72 
 
 
344 aa  309  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.7 
 
 
348 aa  308  9e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.44 
 
 
344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  47.21 
 
 
343 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.31 
 
 
357 aa  301  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  50 
 
 
344 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  45.88 
 
 
344 aa  288  8e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.86 
 
 
359 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  47.43 
 
 
350 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  46.99 
 
 
350 aa  282  8.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  45.13 
 
 
350 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.71 
 
 
345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  45.71 
 
 
345 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  43.53 
 
 
334 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.71 
 
 
345 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  43.5 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  42.86 
 
 
335 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  40.82 
 
 
369 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  39.78 
 
 
371 aa  249  8e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  37.33 
 
 
381 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  39.71 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  38.97 
 
 
364 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  39.88 
 
 
344 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  32.36 
 
 
354 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  32.07 
 
 
354 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  32.36 
 
 
354 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08051  putative cobalamin synthesis protein  35.2 
 
 
350 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  35.34 
 
 
337 aa  185  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  32.87 
 
 
319 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  34.17 
 
 
320 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  33.24 
 
 
323 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  34.36 
 
 
323 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  33.98 
 
 
323 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.68 
 
 
316 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  33.98 
 
 
323 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.59 
 
 
316 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  33.05 
 
 
323 aa  180  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  33.15 
 
 
323 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  32.23 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  33.79 
 
 
404 aa  179  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.48 
 
 
319 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  31.75 
 
 
319 aa  179  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  33.89 
 
 
335 aa  179  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.75 
 
 
316 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.48 
 
 
316 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.48 
 
 
316 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  34.3 
 
 
349 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.75 
 
 
316 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>