More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2436 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  100 
 
 		 344 aa  677    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  90.41 
 
 		 344 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  79.94 
 
 		 344 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  82.56 
 
 		 344 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  79.94 
 
 		 344 aa  521  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  79.65 
 
 		 344 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  70.5 
 
 		 345 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  61.52 
 
 		 348 aa  421  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  63.42 
 
 		 349 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  59.53 
 
 		 343 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  55.13 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  64.53 
 
 		 344 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  57.85 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.96 
 
 		 349 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.37 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  54.55 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.55 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  56.4 
 
 		 344 aa  368  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  60.77 
 
 		 350 aa  363  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.8 
 
 		 354 aa  359  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.49 
 
 		 357 aa  352  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  54.88 
 
 		 350 aa  342  7e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  51.87 
 
 		 386 aa  341  8e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.23 
 
 		 363 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  52.52 
 
 		 367 aa  335  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  56.02 
 
 		 345 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.42 
 
 		 350 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.27 
 
 		 358 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  58.46 
 
 		 350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  52.14 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  56.63 
 
 		 345 aa  327  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  56.63 
 
 		 345 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.71 
 
 		 348 aa  326  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  52.75 
 
 		 348 aa  326  4.0000000000000003e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.49 
 
 		 349 aa  325  7e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.96 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  51.8 
 
 		 357 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.8 
 
 		 357 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.8 
 
 		 357 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.8 
 
 		 357 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.1 
 
 		 357 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.1 
 
 		 357 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.8 
 
 		 390 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  52.44 
 
 		 335 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  52.2 
 
 		 335 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.06 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.62 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  52.74 
 
 		 346 aa  318  6e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.17 
 
 		 358 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.62 
 
 		 355 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  51.78 
 
 		 354 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.62 
 
 		 355 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  51.18 
 
 		 354 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.73 
 
 		 359 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.86 
 
 		 369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.89 
 
 		 362 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  50.15 
 
 		 362 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.7 
 
 		 344 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  49.41 
 
 		 362 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  50 
 
 		 362 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.41 
 
 		 362 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.41 
 
 		 362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  48.7 
 
 		 357 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.94 
 
 		 349 aa  301  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  50 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.1 
 
 		 348 aa  298  8e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.7 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  50 
 
 		 343 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.33 
 
 		 360 aa  280  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  39.53 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  35.38 
 
 		 354 aa  242  9e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  40.06 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  35.09 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  35.09 
 
 		 354 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  41.09 
 
 		 369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  39.51 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  39.67 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  37.88 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08051  putative cobalamin synthesis protein  32.74 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  31.42 
 
 		 323 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  35.11 
 
 		 347 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  31.98 
 
 		 394 aa  169  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.61 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.61 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.03 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.73 
 
 		 316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  33.03 
 
 		 319 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.03 
 
 		 316 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.43 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.73 
 
 		 316 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  32.73 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.43 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.73 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  32.73 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  31.38 
 
 		 404 aa  162  7e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  31.4 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  34.99 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  31.19 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  32.32 
 
 		 320 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>